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Ich werde Genomsequenzierungsdaten mit Bioinformatik-Tools analysieren
Genomdaten mit Bioinformatik analysieren oder deine Excel-Daten aufräumen!
Hi, ich bin Zoë, eine Forschungsexpertin, die sich auf NGS-Datenanalyse spezialisiert hat. Ich arbeite mit genomischen und metagenomischen Daten von Bakterien, Viren und Tieren. Ich nutze Bioinformati...
Über diesen Service
Bitte kontaktiere mich vor der Bestellung, damit wir den Projektumfang, die Datenübertragungsoptionen und die Liefererwartungen klären können.
Ich biete genomische Datenanalyse von prokaryotischem WGS an, die auf deine Forschungsbedürfnisse zugeschnitten ist.
Mit Fachwissen in Genomik und Bioinformatik entwickle und führe ich individuelle Pipelines durch, um präzise und publikationsfertige Ergebnisse zu liefern.
Meine Dienstleistungen
- Qualitätskontrolle & Vorverarbeitung von FASTQ-Dateien
- Abgleich der Reads mit Referenzgenomen (WGS)
- De-novo-Assembly für Projekte ohne geeignetes Referenzgenom
- Varianten-Calling & Annotation (SNPs, Indels)
- Metagenomische Klassifikation & mikrobielles Profiling
- Vergleichende Genomik und Erstellung individueller Berichte
Tools & Fachwissen
- Command-Line-Interface (CLI) für interaktive Ausführung und Troubleshooting von Bioinformatik-Workflows
- Bash-Skripting für Automatisierung, reproduzierbare Pipelines und Hochdurchsatzverarbeitung
- HPC-Umgebungen für effiziente groß angelegte Genomanalysen: AWS
- Bioinformatik-Tools: BWA, SAMtools, BCFtools, FastQC, Roary, Prokka, RAxML
- Referenzdatenbanken: NCBI, GenBank, CARD, VFDB
Was du bereitstellen musst:
- Rohdaten der Sequenzierung (FASTQ-Dateien, komprimiert bei großen Daten)
- Referenzgenom
Technologie:
Python
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Andere
FAQ
Automatische Übersetzung
Muss ich Sie vor der Bestellung kontaktieren?
Ja. Bitte kontaktiere mich zuerst, damit wir die Details deines Projekts, die Datenübertragungsoptionen und die Liefererwartungen besprechen können.
Q: Wie soll ich meine FASTQ-Dateien teilen?
FASTQ-Dateien können sehr groß sein, daher empfehle ich die Nutzung eines Cloud-Speicher-Links (Google Drive oder OneDrive). Bitte komprimiere deine Dateien (.gz), bevor du sie teilst, um die Übertragung zu beschleunigen.
Was ist die maximale Datensatzgröße für den Service?
Damit die Verarbeitung und der Dateiaustausch reibungslos verlaufen, liegt das maximale Dateilimit pro Auftrag bei 30 GB.
