Ich werde Molekulardynamik-Trajektorien und Protein-Ligand-Kontakte analysieren

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Bioinformatik Virtuelle Knockout Molekulardynamik RNAseq DTA

Ich bin Daniel Zhang, Bioinformatik-Forscher in Changsha, China, mit Masterabschluss. Ich analysiere virtuelle Knockout-Ergebnisse von Genen, Molekulardynamik-Trajektorien, Vorhersagen zur Affinität v...
Über diesen Service

Ich analysiere vorhandene Molekulardynamik-Trajektorien und liefere klare Abbildungen sowie die numerischen Daten dahinter.


Basic deckt ein bereitgestelltes System bis zu 100 ns ab: Abgleichen von Dateien, Protein- und Ligand-RMSD, Residuen-RMSF, bearbeitbare CSV-Tabellen, Abbildungen, Analyse-Skripte und eine README-Datei, die Auswahlen, Referenzen und das Zeitfenster festhält.


Bitte liefere passende Trajektorien-, Topologie- und Strukturdateien, eine Systembeschreibung und deine Forschungsfrage. Kontakt-Details, Pocket-Abstände und Vergleiche mehrerer Systeme werden separat behandelt.


Für eine neue Protein-Kleinstoff-Simulation schicke mir die Protein- oder Gen-ID, Spezies und Namen der Verbindung oder SMILES. Strukturvorbereitung, Parameterauswahl, ein 10-ns-Pilotprojekt und längere Cloud-Läufe können nach Überprüfung des Systems und des Rechenbedarfs separat angeboten werden.


Schreib mir vor der Bestellung, um Kompatibilität der Dateien und den Umfang zu bestätigen. Schriftliche Kommunikation ist willkommen. Ich nutze KI-gestützte Codierung und überprüfe Code und Ausgaben; teile mir bitte deine Daten-Verarbeitungsrestriktionen vor dem Teilen von Dateien mit.

Technologie:

Jupyter-Notizbuch

Analyse-Typ:

Quantitative Analyse

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Deskriptive Analyse

Expertise:

Statistiken

•

Zeitreihenanalyse

Programmiersprache:

Python

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R

Tools:

Andere