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Ich werde Transkriptomik-Datenanalyse und Visualisierung mit R oder Python durchführen
Rechnerischer Biologe
Ich arbeite an der Schnittstelle von computergestützter Biologie, Machine Learning und translationaler Forschung mit Schwerpunkt auf Genomik und Biomarker-Entdeckung. Mein Hintergrund umfasst Molekula...
Über diesen Service
Ich biete Transkriptomik-Datenanalyse an, inklusive RNA-seq-Expressionsanalyse, statistischer Tests, Visualisierung (PCA, Heatmaps, Volcano-Plots) und grundlegender Machine-Learning-Modelle für Klassifikation und biologische Interpretation mit R oder Python.
Transkriptomik-Analyse umfasst:
- RNA-seq-Datenverarbeitung (Counts / Expressionsmatrix)
- Differenzielle Expressionsanalyse (Grundlegende Statistiken: t-Test, DE-ähnliche Vergleiche, falls Daten vorliegen)
- Daten-Normalisierung (Grundlegendes Skalieren / Log-Transformation)
- Explorative Analyse:
- PCA-Diagramme
- Heatmaps
- Volcano-ähnliche Diagramme (falls DE-Ergebnisse vorhanden)
- Gruppenkontrast (Kontrolle vs. Krankheit usw.)
Statistische Analyse umfasst:
- Durchschnitt, Varianz, Fold-Change
- Gruppenkontraste (t-Test / grundlegende statistische Tests)
- Korrelation
- Grundlegende Interpretation der Ergebnisse
Machine Learning :
- Grundlegende Klassifikationsmodelle:
- Logistische Regression
- Zufallswald
- Merkmalsauswahl
- Modelbewertung:
- Genauigkeit, Konfusionsmatrix
- ROC-Kurve
Alle Pakete enthalten wiederholbare Code-Skripte (R/Python), damit du die Analyse vollständig reproduzieren und validieren kannst
Individuelle Aufträge sind ebenfalls willkommen, basierend auf spezifischen Datensätzen, Analyseanforderungen und Forschungszielen

