Ich werde Transkriptomik-Datenanalyse und Visualisierung mit R oder Python durchführen

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Rechnerischer Biologe

Ich arbeite an der Schnittstelle von computergestützter Biologie, Machine Learning und translationaler Forschung mit Schwerpunkt auf Genomik und Biomarker-Entdeckung. Mein Hintergrund umfasst Molekula...
Über diesen Service

Ich biete Transkriptomik-Datenanalyse an, inklusive RNA-seq-Expressionsanalyse, statistischer Tests, Visualisierung (PCA, Heatmaps, Volcano-Plots) und grundlegender Machine-Learning-Modelle für Klassifikation und biologische Interpretation mit R oder Python.


Transkriptomik-Analyse umfasst:

  • RNA-seq-Datenverarbeitung (Counts / Expressionsmatrix)
  • Differenzielle Expressionsanalyse (Grundlegende Statistiken: t-Test, DE-ähnliche Vergleiche, falls Daten vorliegen)
  • Daten-Normalisierung (Grundlegendes Skalieren / Log-Transformation)
  • Explorative Analyse:
  • PCA-Diagramme
  • Heatmaps
  • Volcano-ähnliche Diagramme (falls DE-Ergebnisse vorhanden)
  • Gruppenkontrast (Kontrolle vs. Krankheit usw.)


Statistische Analyse umfasst:

  • Durchschnitt, Varianz, Fold-Change
  • Gruppenkontraste (t-Test / grundlegende statistische Tests)
  • Korrelation
  • Grundlegende Interpretation der Ergebnisse


Machine Learning :

  • Grundlegende Klassifikationsmodelle:
  • Logistische Regression
  • Zufallswald
  • Merkmalsauswahl
  • Modelbewertung:
  • Genauigkeit, Konfusionsmatrix
  • ROC-Kurve


Alle Pakete enthalten wiederholbare Code-Skripte (R/Python), damit du die Analyse vollständig reproduzieren und validieren kannst


Individuelle Aufträge sind ebenfalls willkommen, basierend auf spezifischen Datensätzen, Analyseanforderungen und Forschungszielen

Programmiersprache:

Python

R

Technologie:

Andere

Analyse-Typ:

Quantitative Analyse

statistische Analyse

Expertise:

Versuchsplanung

Algorithmen

Statistiken

Tools:

RStudio

Google Colab