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Ich werde RNA-Seq-Differentialgene-Expression-Analyse mit edger oder deseq durchführen
Bioinformatik-Analyst und Wissenschaftsschreiber für RNA Seq und NGS-Daten
Ich bin MS Bioinformatik-Student an der NUST mit einem BSc in Optometrie. Ich habe praktische Erfahrung
in der Analyse von Next-Generation-Sequencing (NGS)-Daten. Meine Fähigkeiten umfassen RNA-Seq-A...
Über diesen Service
Suchst du nach professioneller RNA-Seq-Differentialgene-Expression-Analyse?
Ich werde eine vollständige DGE-Analyse deiner Count-Matrix-Daten mit edgeR oder DESeq2 in R durchführen.
Was du bekommst:
- Qualitätskontrolle (PCA-Plot und Heatmap)
- Ausreißererkennung und -entfernung
- TMM-Normalisierung
- Differentiale Expression Analyse
- Volcano-Plot mit hervorgehobenen signifikanten Genen
- Vollständige Ergebnisse als CSV-Datei
- Zusammenfassung der hochregulierten und herunterregulierten Gene
Ich habe praktische Erfahrung in der Analyse großer RNA-Seq-Datensätze mit Hunderten von Proben unter Verwendung der edgeR- und DESeq2-Pipelines in R.
Bitte schreibe mir vor der Bestellung, um deine Daten und Anforderungen zu besprechen!
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Mein Portfolio
FAQ
Automatische Übersetzung
In welchem Format sollten meine Daten vorliegen?
Ich benötige eine rohe Count-Matrix im .txt- oder .csv-Format und eine Metadaten-Datei mit Sample-Gruppen-Informationen.
Welches Tool verwendest du, edgeR oder DESeq2?
Ich kann entweder edgeR oder DESeq2 verwenden, je nach deiner Präferenz. Beide liefern zuverlässige Ergebnisse für RNA-Seq-DGE-Analysen.
Was erhalte ich nach der Analyse?
Du erhältst hochauflösende Abbildungen, einschließlich PCA-Plot, Heatmap und Volcano-Plot, eine CSV-Datei mit allen Ergebnissen und eine Zusammenfassung der differenziell exprimierten Gene.
