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Ich führe Molekulardocking und Dynamiksimulationen durch
Dr. Zainab K.
Level 2
1 Aufträge in der Warteschlange
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Über diesen Service
Automatische Übersetzung
Schreib uns vor der Bestellung, um dein Projekt individuell anzupassen!
Bei The Freelance Bubble bieten wir Expertenniveau bei molekularen Docking- und MD-Simulationen, um deine Wirkstoffforschungsprojekte zu unterstützen. Vom Liganden-Screening bis zur Analyse der Bindungsstabilität liefern wir reproduzierbare, publikationsreife Ergebnisse.
- Docking Starter: Docking von 1-2 Liganden mit Zielprotein + Bindungsaffinität und Pose-Visualisierung. ADMET-Analyse.
- Binding Insight: 5-10 Liganden, Interaktionsanalyse, Bindungsstellen-Mapping und vergleichende Docking-Scores. ADMET-Analyse.
- Dynamic Discovery Suite: Komplettes Docking + MD-Simulationen (bis zu 100 ns) mit RMSD, RMSF, Rg und Bindungsstabilitätsdiagrammen. (Bespreche, falls du mehr Simulationszeit benötigst)
Tools und Ressourcen:
- Protein-Ligand-Docking (AutoDock, PyRx),
- MD-Simulationen (GROMACS/AMBER),
- Interaktions- und Stabilitätsanalyse (RMSD, RMSF, Rg, SASA),
- Energieberechnungen und Visualisierungen (PyMOL, Chimera).
- ADMET-Analyse (SwissADME)
Enthält detaillierte Berichte, Diagramme und reproduzierbare Skripte (auf Anfrage).
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Lerne Dr. Zainab K. kennen
Dr. Zainab K.
Cofounder The Freelance Bubble
Level 2
- AusPakistan
- Mitglied seitMai 2025
- ⌀ Antwortzeit1 Stunde
- Letzte Lieferung4 Wochen
Sprachen
Englisch, Urdu, Punjabi
As Co-Founder of The Freelance Bubble, I lead a team of 23+ PhD scholars dedicated to delivering high-quality academic and research support services, including Systematic Reviews, Meta-Analyses, Molecular Simulations, Bioinformatics, Data Analysis, and Scientific Writing.
Besides TFB, I am Biotechnologist turned Bioinformatician, I specialize in in-silico vaccine design, drug repurposing, and coding pipelines. We also organize workshops and training programs to advance research and computational expertise.
We also help start-ups in brandings and visuals.
Own a clothing brand, NayeeReet.
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FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Eingabedateien benötigst du von mir?
In der Regel brauche ich deine Proteinstruktur (PDB-Format) und Liganden im MOL2/SDF/PDBQT-Format. Falls du sie nicht hast, kann ich bei der Vorbereitung helfen.
Welche Software verwenden Sie?
Ich verwende AutoDock Vina, PyRx für das Docking und GROMACS (oder auf Anfrage AMBER) für MD-Simulationen. Visualisierungen erstelle ich mit PyMOL, Chimera oder VMD.
Kannst du Simulationen für jedes Protein durchführen?
Ja, solange eine gültige 3D-Struktur vorliegt (PDB oder Homologiemodell), kann ich Docking und MD-Simulationen dafür durchführen.
Bekomme ich einen Bericht?
Ja. Jedes Paket enthält einen detaillierten PDF-Bericht mit Methoden, Ergebnissen, Diagrammen (z.B. RMSD, RMSF) und Bindungsvisualisierungen. Premium-Pakete beinhalten auch Input/Output-Dateien und Skripte.
Sind diese Ergebnisse für Publikationen oder Abschlussarbeiten geeignet?
Absolut. Ich folge forschungsrelevanten Workflows und liefere publikationsfertige Visualisierungen und Daten.
Werden meine Daten vertraulich behandelt?
Ja. Deine Daten sind vollständig vertraulich und werden unter keinen Umständen geteilt oder wiederverwendet.
Bewertungen
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Algerien
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