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Ich führe Molekulardocking und Dynamiksimulationen durch
Dr. Zainab K.
Level 2
1 Aufträge in der Warteschlange
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Über diesen Service
Automatische Übersetzung
Bei The Freelance Bubble bieten wir professionelle molekulare Docking- und Molekulardynamik-Simulationsdienste für die Wirkstoffforschung, virtuelle Screening und Protein-Ligand-Interaktionsstudien an. Unser Fokus liegt auf reproduzierbaren Workflows, klarer Interpretation und ergebnisorientierten Veröffentlichungen.
Unsere Pakete umfassen:
- Docking Starter: Docking von 1-2 Liganden mit einem Zielprotein, inklusive Bindungsaffinität, Visualisierung des besten Poses, Interaktionsanalyse und ADMET-Bewertung.
- Binding Insight: Docking von 5-10 Liganden mit vergleichenden Scores, Bindungsstellen-Mapping, Interaktionsprofil, Pose-Analyse und ADMET-Bewertung.
- Dynamic Discovery Suite: Komplettes Docking plus MD-Simulation bis zu 100 ns, inklusive RMSD, RMSF, Gyrationsradius, SASA und Bindungsstabilitätsanalyse. Längere Simulationen können über ein individuelles Angebot arrangiert werden.
Tools: AutoDock, PyRx, GROMACS, AMBER, PyMOL, Chimera und SwissADME.
Lieferungen können Diagramme, Interaktionsabbildungen, Ergebnistabellen, detaillierte Berichte und reproduzierbare Skripte auf Anfrage umfassen.
Bitte kontaktiere uns vor der Bestellung, um dein Projekt individuell anzupassen.
Lerne Dr. Zainab K. kennen
Dr. Zainab K.
Cofounder The Freelance Bubble LLC
Level 2
- AusPakistan
- Mitglied seitMai 2025
- ⌀ Antwortzeit1 Stunde
- Letzte Lieferung2 Wochen
Sprachen
Englisch, Urdu, Punjabi
As Co-Founder of The Freelance Bubble, I work with a multidisciplinary team of 23+ PhD scholars delivering high-quality research and technical support. I am a biotechnologist turned bioinformatician specializing in in-silico vaccine design, immunoinformatics, drug repurposing, molecular docking, genomics, NGS analysis, and computational pipelines. I also contribute to research workshops and training programs, support startup with branding and visuals, and am involved in entrepreneurship through the clothing brand NayeeReet.
Automatische Übersetzung
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FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Eingabedateien benötigst du von mir?
In der Regel brauche ich deine Proteinstruktur (PDB-Format) und Liganden im MOL2/SDF/PDBQT-Format. Falls du sie nicht hast, kann ich bei der Vorbereitung helfen.
Welche Software verwenden Sie?
Ich verwende AutoDock Vina, PyRx für das Docking und GROMACS (oder auf Anfrage AMBER) für MD-Simulationen. Visualisierungen erstelle ich mit PyMOL, Chimera oder VMD.
Kannst du Simulationen für jedes Protein durchführen?
Ja, solange eine gültige 3D-Struktur vorliegt (PDB oder Homologiemodell), kann ich Docking und MD-Simulationen dafür durchführen.
Bekomme ich einen Bericht?
Ja. Jedes Paket enthält einen detaillierten PDF-Bericht mit Methoden, Ergebnissen, Diagrammen (z.B. RMSD, RMSF) und Bindungsvisualisierungen. Premium-Pakete beinhalten auch Input/Output-Dateien und Skripte.
Sind diese Ergebnisse für Publikationen oder Abschlussarbeiten geeignet?
Absolut. Ich folge forschungsrelevanten Workflows und liefere publikationsfertige Visualisierungen und Daten.
Werden meine Daten vertraulich behandelt?
Ja. Deine Daten sind vollständig vertraulich und werden unter keinen Umständen geteilt oder wiederverwendet.
Bewertungen
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Laufende ZusammenarbeitGreat communication, fast responses, and professional work. Very cooperative and reliable. Highly recommended.
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Hilfreich?A audreylee04
Australien
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Vereinigte Staaten
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