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Ich führe mikrobielle RNA-Seq DGE-Analyse mit deseq2 und snakemake durch
Biotechnologieforscher: Mikrobielle Genomik und Bioinformatik
Biotechnologie- & Mikrobiologieforscher mit über 4 Jahren Erfahrung in der computergestützten Genomik.
Meine Arbeiten sind in peer-reviewed Zeitschriften veröffentlicht (siehe meinen Abschnitt 'Zert...
Über diesen Service
Willkommen! Als Doktorand im Bereich Biotechnologie & Mikrobiologie biete ich Expertenanalyse für Microbial RNA-Seq-Daten an.
Ich programmiere nicht nur Code; ich bin ein publizierter Forscher, der die Wissenschaft hinter deinen Ergebnissen versteht. Mein Spezialgebiet ist Differenzielle Genexpression (DGE) und die Identifikation der wichtigsten hoch- bzw. runterregulierten Gene für deine Studie.
### Was dieses Gig bietet (RNA-Seq DGE)
Ich biete drei Analyseebenen basierend auf meinem bewährten Pipeline-Workflow (FastQC, HISAT2, featureCounts, DESeq2). (Siehe unten meine FAQ bezüglich Sample-Anzahl!).
* Basic (Die "Daten"):
Ich führe die komplette Pipeline bis zu Read Counts (Schritt 04) aus. Dieses Paket ist perfekt für Forscher, die R/Python verwenden und nur die finale Counts Matrix benötigen.
* Standard (Die "Analyse"):
Das ist die vollständige DGE-Analyse (Schritt 05). Du erhältst alles aus Basic plus alle wichtigen Visualisierungen: Volcano-Plot, PCA-Plot & Heatmap.
* Premium (Der "PhD-Einblick"):
Das vollständige, publikationsfertige Paket. Du bekommst alles aus Standard plus: einen vollständigen PDF-Bericht mit meiner fachkundigen biologischen Interpretation (das "Warum") und das reproduzierbare Jupyter Notebook, das für deine Analyse verwendet wurde.
**Bitte kontaktiere mich vor der Bestellung, um dein Projekt zu besprechen.
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Programmiersprache:
Python
•
R
•
SPSS
Technologie:
Jupyter Notebook
Expertise:
Cluster-Analyse
Tools:
Pandas
Meine weiteren Dienstleistungen im Bereich Datenanalyse
FAQ
Automatische Übersetzung
Deine Paketpreise nennen keine Anzahl der Proben. Warum?
Die Paketpreise (30 $, 50 $, 80 $) sind eine Basis für kleine Pilotprojekte (z.B. 1-3 Proben). Für größere Kohorten (4, 6 oder 20+ Proben) schicke mir bitte eine Nachricht. Wir besprechen deine Ziele, und ich sende dir ein genaues individuelles Angebot.
Warum sollte ich das Premium-Paket wählen? Was ist der Mehrwert?
Premium ist mein <strong>Insight</strong>-Service auf PhD-Niveau. Ich liefere nicht nur eine Liste von Genen; ich biete einen umfassenden PDF-Bericht mit <strong>biologischer Interpretation</strong> (das "<strong>Warum</strong>"). Außerdem erhältst du das <strong>reproduzierbare Jupyter-Skript</strong> für deine Publikation.
Was brauchst du von mir, um anzufangen?
Ich brauche drei Dinge: 1. Deine Rohdaten im FASTQ-Format (R1 & R2). 2. Das Referenzgenom (FASTA) und die Annotationsdateien (GFF/GTF). 3. Deine Metadaten-Datei (z.B. welche Proben sind 'Control' vs. 'Treated').
