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Ich werde RNA-Seq-Daten von Rohdaten bis zur funktionalen Anreicherung analysieren
Bioinformatiker und Doktorand
Hallo! Ich habe einen MSc in Bioinformatik und bin derzeit Doktorand und Forscher mit Schwerpunkt Genomik und Molekularbiologie. Ich verfüge über umfangreiche Erfahrung im Umgang mit groß angelegten b...
Über diesen Service
Willkommen bei meinem Bioinformatik & RNA-Seq Gig!
Benötigst du eine gründliche, publikationsfertige Analyse deiner Illumina RNA-Seq-Daten? Als MSc in Bioinformatik und aktueller Doktorand biete ich End-to-End-Prozesse, die auf deine Forschung zugeschnitten sind. Ich verwandle Roh-FastQ-Dateien oder Zählmatrizen in klare, reproduzierbare Ergebnisse.
Was ich anbiete:
- Qualitätskontrolle: FastQC und Read-Trimming.
- Ausrichtung: Präzises Mapping auf das Referenzgenom.
- Differenzielle Expression (DEGs): Statistische Analyse mit DESeq2.
- Funktionale Anreicherung: GO- und KEGG-Pfade via clusterProfiler.
- Publikationsfertige Diagramme: Hochauflösende Heatmaps, Volcano-Plots, PCA und Netzwerke.
Tools: R, Python und Bioconductor-Pakete.
⭐ Warum ich?
- Akademische Strenge: Aktiver Forscher mit zuverlässigen Pipelines.
- Reproduzierbarkeit: Saubere Skripte, bereit für deinen Methodenabschnitt.
- Biologischer Fokus: Engagiert für deine spezifische Forschungsfrage.
️ WICHTIG: Bitte schreibe mir BEVOR du bestellst! Wir müssen dein Versuchsdesign und die Stichprobengröße besprechen, um das beste individuelle Angebot zu garantieren. Lass uns deine Arbeit veröffentlichen!
FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Dateitypen muss ich bereitstellen, um die Bestellung zu starten?
Das hängt vom gewählten Paket ab. Für das Basic-Paket benötige ich deine Roh-Sequenzdaten (FASTQ-Dateien). Für die Standard- und Premium-Pakete kannst du, falls du bereits die Ausrichtung durchgeführt hast, die Roh-Zählmatrix (.csv, .tsv oder .txt) bereitstellen.
Wie viele Proben sind im Grundpreis enthalten?
Die Grundpreise aller Pakete decken eine Analyse von bis zu 6 Proben ab (z.B. 3 Kontrollproben vs. 3 Behandlungsproben). Wenn dein Versuchsdesign mehr Proben umfasst, kontaktiere mich bitte für ein individuelles Angebot, da die Bearbeitungszeit steigt.
Kannst du Daten von Nicht-Modellorganismen analysieren?
Ja! Solange ein annotiertes Referenzgenom und eine GTF/GFF-Datei in öffentlichen Datenbanken (wie NCBI oder Ensembl) verfügbar sind, kann ich die Analyse durchführen. Bitte kontaktiere mich vor der Bestellung, damit ich die Verfügbarkeit des Referenzgenoms für dein Organismus prüfen kann.
Werde ich die für meine Analyse verwendeten Skripte erhalten?
Ja! Wenn du das Premium-Paket wählst, stelle ich dir die sauberen, gut kommentierten R- oder Python-Skripte zur Verfügung, die zur Erstellung deiner Ergebnisse verwendet wurden. Das sorgt für vollständige Transparenz und Reproduzierbarkeit, sodass du deinen Methodik-Abschnitt leicht verfassen kannst.
Was, wenn ich eine sehr spezifische oder hochgradig angepasste Abbildung für meine Arbeit benötige?
Die Standard- und Premium-Pakete beinhalten bereits hochwertige, standardisierte Diagramme (wie PCA, Volcano-Plots und Heatmaps). Wenn du jedoch eine hochspezifische oder maßgeschneiderte Abbildung (wie komplexe Interaktionsnetzwerke oder spezielle Themes) benötigst, kannst du die Option "Extra Custom Plot" hinzufügen.
Wie sende ich dir meine großen Datenfiles (FASTQ)?
Fiverr hat eine Dateigrößenbeschränkung für direkte Uploads. Für große Sequenzdateien kannst du einen sicheren Link über Google Drive, Dropbox, OneDrive oder direkt von Sequenzierungsservern/-repositories (wie SRA/ENA) teilen, und ich lade sie sicher herunter.
