Ich werde rnaseq-Zeitreihendaten analysieren

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Ich arbeite seit 2015 auf dem Gebiet der Bioinformatik. Ich habe Erfahrung in der Assemblierung und Annotation von Genomen, der RNAseq-Datenanalyse von Modell- und Nichtmodellarten (mit komplexen expe...
Über diesen Service

Sie haben Zeitreihendaten aus einem RNA-Sequenzierungsexperiment mit mehreren Proben, Zeitpunkten (und vielleicht Bedingungen?) und sind ganz verrückt danach, paarweise Vergleiche anzustellen??? Ich kann eine elegante und formale Zeitverlaufsanalyse bereitstellen, die die Zeit in die Analyse einbezieht und die Gene bestimmt, deren Expression sich mit der Zeit ändert. Indem ich diese Informationen in biologische Datenbanken integriere, kann ich Gene basierend auf ähnlichen zeitlichen Expressionsprofilen clustern und nach Profilen suchen, die aus Genen bestehen, die zum selben Pfad/Prozess gehören.

Daher werde ich einen biologischen Einblick in den Zeitreihendatensatz geben. Es können auch benutzerdefinierte biologische Datenbanken verwendet werden.

Programmiersprache:

R

Technologie:

Excel

Jupyter-Notizbuch

Analyse-Typ:

Quantitative Analyse

statistische Analyse

Expertise:

Versuchsplanung

Trends

Algorithmen

Mathematik

Tools:

Andere