Ich werde RNA-seq und bioinformatische Datenanalyse durchführen
Ph.D. Biologe Molekulare Genetik, Endokrinologie und Bioinformatik
Über diesen Service
Ich biete bioinformatische Unterstützung für RNA-seq- und transkriptomische Projekte, einschließlich Qualitätskontrolle, Read-Trimming, Transkript-Quantifizierung, Gen-Zählung, de novo Transkriptom-Assembly und Differential-Expressions-Analyse. Ich erstelle auch PCA-Plots, Heatmaps, Volcano-Plots, MA-Plots, normalisierte Zähltabellen und Abbildungen für bestimmte Gene von Interesse. Ich arbeite in R-, Python- und Linux-Umgebungen und habe Erfahrung mit Tools wie DESeq2, Salmon, tximport, featureCounts und fastp. Jedes Projekt wird auf die Organismen, das experimentelle Design, verfügbare Referenzdateien und die spezifischen Fragen, die du beantworten möchtest, zugeschnitten.
Programmiersprache:
Python
•
R
Technologie:
Excel
•
Google Sheets
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Jupyter-Notizbuch
•
Andere
Expertise:
Versuchsplanung
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Statistiken
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Andere
Tools:
RStudio
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Microsoft Excel
