Ich werde scrna seq, räumliche Transkriptomik und ngs Daten analysieren
Doktorand
Über diesen Service
Erhalte publication-ready NGS-Datenanalyse von einem erfahrenen Bioinformatiker
Ich spezialisiere mich auf Next-Generation Sequencing (NGS) Datenanalyse und habe praktische Erfahrung bei der Lieferung von Ergebnissen für peer-reviewed Veröffentlichungen. Ich verwandle Rohdaten in klare, publication-ready biologische Erkenntnisse, unterstützt durch fundiertes Fachwissen in experimenteller Biologie.
Meine angebotenen Dienstleistungen:
- scRNA-Seq Analyse: End-to-End-Pipeline QC, Dimensionsreduktion (PCA/UMAP), Clustering, Zelltyp-Annotation und Trajektorien-Inferenz (Seurat/Bioconductor)
- Räumliche Transkriptomik: Integration mit scRNA-seq-Daten, Genexpression in Gewebe-Morphologie, räumliche Gen-Identifikation
- Bulk RNA-Seq: FastQC, Alignment, Differential-Expression-Analyse (DESeq2), funktionelle Anreicherung (GO/KEGG)
- Datenvisualisierung: Hochauflösende, publication-ready Abbildungen (Heatmaps, Volcano-Plots, benutzerdefinierte Plots in ggplot2/ComplexHeatmap)
Tools & Technologien:
Sprachen: R (Tidyverse, Bioconductor), Bash/Linux
Datenarten: FASTQ, BAM, VCF, Count Matrices
Warum mit mir arbeiten:
Methoden basieren auf aktueller Literatur und wissenschaftlicher Strenge
Sauberer, reproduzierbarer Code mit detaillierten Analyseberichten
Klare Kommunikation und schnelle Bearbeitung
Technologie:
Excel
•
Jupyter-Notizbuch
•
Pandas
•
RStudio
Expertise:
Versuchsplanung
•
Cluster-Analyse
•
Regressionstests
Programmiersprache:
Python
•
R

