Kategorien durchsuchen
Entdecken
Fiverr Pro
Deutsch
$
USD
Ich führe Gromacs-Molekulardynamik-Simulation für dein Protein durch
Bioinformatik und Rechnerchemie, Impfstoffdesign, MD-Simulation, DFT
Ich helfe Studierenden und Forschern dabei, saubere, verteidigungsfähige Ergebnisse bei Impfstoffdesign, Molekulardynamik-Simulationen, DFT-Berechnungen und Proteinstrukturvorhersagen zu erzielen – ga...
Über diesen Service
Ich führe vollständige molekulare Dynamik-Simulationen mit GROMACS in einer Linux-Umgebung durch, inklusive Energie-Minimierung, NVT/NPT-Äquilibrierung, Produktionslauf und nachgelagerter Strukturanalyse mit allen Ergebnissen, die grafisch dargestellt und erklärt werden.
Ich kann dir dabei helfen:
- Deine Proteinstruktur (PDB-Datei) vorzubereiten und zu minimieren
- NVT- und NPT-Äquilibrierung mit Temperatur-, Druck- und Dichteplots durchzuführen
- Eine Produktionssimulation laufen zu lassen
- RMSD zu berechnen (strukturelle Stabilität im Zeitverlauf)
- RMSF zu berechnen (Flexibilität pro Rest)
- Radius der Gyration zu bestimmen (Protein-Kompaktheit)
- Eine schriftliche Zusammenfassung zu liefern, die erklärt, was die Ergebnisse für die Stabilität deines Proteins bedeuten
Perfekt für Studierende, die eine vollständige MD-Simulation mit ordentlicher Strukturanalyse für eine Abschlussarbeit, Aufgabe oder Forschungsprojekt brauchen — nicht nur Rohdaten, sondern eine klare Erklärung, was sie aussagen.
Technologie:
Google Analytic
•
Google Data Studio
Analyse-Typ:
Deskriptive Analyse
•
Prädiktive Analyse
Expertise:
Prognose
•
Wahrscheinlichkeit
•
Mathematik
Programmiersprache:
Python
Mein Portfolio
FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Dateiformate muss ich bereitstellen?
Eine PDB-Datei deiner Proteinstruktur (oder die Rohsequenz, falls du noch keine hast — ich kann dir zuerst beim Erstellen einer Struktur helfen).
Wie lange dauert die Produktionssimulation?
Standardläufe sind kurze Simulationen (geeignet für erste Stabilitätsprüfungen). Wenn du längere Produktionsläufe brauchst (mehrere Nanosekunden), schreib mir vor der Bestellung, damit ich dir die Lieferzeit und den Preis genau nennen kann.
Welche Software verwenden Sie?
GROMACS auf Linux, mit Analyseplots, die mit Grace (xmgrace) erstellt wurden.
Verstehe ich die Ergebnisse, wenn ich mit MD-Simulationen nicht vertraut bin?
Ja — jedes Paket enthält eine Erklärung in einfacher Sprache, was die Plots und Analysen für die Stabilität deines Proteins bedeuten, nicht nur die Rohdateien.
