Ich führe Docking- und molekulardynamische Simulationen durch

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Usman Shahid
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Über diesen Service

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Hallo Fiverr, hier ist Usman. Ich bin ein computational biologist, der an Drug Discovery, Proteinhemmung und vielen anderen Bereichen arbeitet. Ich habe PhD- und MPhil-Studierende bei der Fertigstellung ihrer Forschung unterstützt.

  1. Docking Starter: Docking von 1-2 Liganden mit Zielprotein + Bindungsaffinität und Pose-Visualisierung. ADMET-Analyse.
  2. Binding Insight: 5-10 Liganden, Interaktionsanalyse, Bindungsstellenkartierung und vergleichende Docking-Ergebnisse. ADMET-Analyse.
  3. Dynamic Discovery Suite: Komplettes Docking + MD-Simulationen (von 10 bis 100 ns) mit RMSD, RMSF, Rg und Bindungsstabilitätsdiagrammen. (Besprich, wenn du mehr Simulationszeit benötigst.)
  4. Weitere Services sind ebenfalls verfügbar, um deine Forschung noch wirkungsvoller zu machen, wie MMPBSA, MMGBSA, H-Bond-Analyse usw.
  5. Wenn du über Forschungsprojekte sprechen möchtest, die ebenfalls verfügbar sind.

  • Anwendung

    • Python

  • Diagrammtyp

    • Vergleich
    • Verteilung
    • Muster

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Usman Shahid

molecular docking, Molecular dynamic simulations

  • AusPakistan
  • Mitglied seitDez. 2022
  • ⌀ Antwortzeit1 Stunde

  • Sprachen

    Englisch
I am a computational biology researcher specializing in structure-based drug discovery and molecular docking. I use AutoDock Vina and PyMOL to perform end-to-end virtual screening pipelines — from target protein preparation to ligand docking, interaction analysis, and drug-likeness evaluation using Lipinski and Veber filters. What you get: Target protein preparation from PDB Molecular docking using AutoDock Vina Virtual screening of compound libraries ADMET & drug-likeness evaluation 10-100ns simulations in AMBER Clean report with results and binding scores.

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