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Ich werde RNA-seq Bioinformatik-Analyse durchführen und einen klaren Bericht liefern
Bioinformatik-Analyst, Genomdatenanalyse
Ich bin Bioinformatik-Analyst und Doktorand in Genetik mit Erfahrung in Genomik, Transkriptomik und biologischer Datenanalyse. Ich arbeite mit Python, R, Bash, Linux und bioinformatischen Tools. Meine...
Über diesen Service
Ich biete klare und reproduzierbare Bioinformatik-Analysen für RNA-seq- und Transkriptomik-Projekte an.
Das Basic-Paket ist für verarbeitete RNA-seq-Daten geeignet, wie z.B. eine Zählmatrix, Expressions-Tabelle, Transkript-Annotation oder andere analysebereite Dateien. Es umfasst bis zu 12 Proben und einen definierten Vergleich.
Je nach deinen Daten und Forschungsfrage kann die Analyse folgende Punkte beinhalten:
-Datenprüfung, Filterung und Normalisierung
-PCA und Probenclustering
-Unterschiedliche Genexpressionsanalyse
-DEG-Tabellen und Expressionszusammenfassungen
-Heatmaps, Volcano-Plots und andere Visualisierungen
-Transkript- oder Isoform-Analyse für geeignete Datensätze
-Reproduzierbare Skripte in R oder Python
-Eine kurze Zusammenfassung der Methoden und wichtigsten Ergebnisse
Lieferungen können verarbeitete Tabellen, Abbildungen, Skripte und eine Ergebniszusammenfassung umfassen.
Bitte kontaktiere mich vor der Bestellung. Sende mir dein Organismus, die Anzahl der Proben, experimentelle Gruppen, verfügbare Dateitypen und die Hauptforschungsfrage.
Rohdatenverarbeitung von FASTQ, mehr als 12 Proben, mehrere Vergleiche, komplexe Designs, Long-Read-Isoform-Entdeckung und funktionelle Anreicherung sind im Basic-Paket nicht enthalten. Diese können als individuelles Projekt besprochen werden.
