Ich verarbeite und analysiere deine Genom- oder VCF-Daten mit Python

Hast du Genomdaten, die verarbeitet, gefiltert oder 

annotiert werden müssen, aber weißt nicht, wo du anfangen sollst?

Ich erstelle eine zuverlässige bioinformatische Pipeline, um deine 

VCF-, BCF- oder GWAS-Daten mit branchenüblichen Tools zu verarbeiten und 

saubere, annotierte und analysebereite Ergebnisse zu liefern.

Was ich machen kann:

VCF/BCF-Dateiverarbeitung und Formatkonvertierung

Variantenfilterung nach Qualität, Tiefe und Allelfrequenz

SNP-Annotation mit Ensembl VEP

GWAS-Datenverarbeitung mit PLINK

bcftools QC-Statistiken und Zusammenfassungsberichte

Dateiformatkonvertierungen (VCF, BCF, PLINK, haps/sample)

Automatisierung des vollständigen Workflows mit Python

Datenvisualisierung von Variantenverteilungen und Qualitätsmetriken

Was du bekommst:

Verarbeitete, gefilterte Ausgabedateien

QC-Zusammenfassungsbericht

Python-Workflow-Skript (sauber, kommentiert, wiederverwendbar)

Klare Dokumentation und Gebrauchsanweisung

Ich arbeite mit bcftools, tabix, PLINK, Ensembl VEP und Python 

die gleichen Tools, die in Produktions-GWAS- und Genomforschungs-Pipelines verwendet werden.

Bitte schreibe mir vor der Bestellung, um dein Dataset und deine Ziele zu beschreiben.