Ich werde Genom-Varianten-Calling und Genannotierung mit GATK durchführen

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Ali Naqvi

Pakistan

Ich spreche Urdu, Englisch

Bioinformatik- und biomedizinischer KI-Spezialist

Ich bin ein Bioinformatik- und biomedizinischer KI-Spezialist, der genaue, reproduzierbare Forschungsergebnisse liefert. - NGS-, RNA-seq- und WGS-Analysen - Einzelzell-RNA-seq — Clustering, UMAP, Tra...
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Über diesen Service

Hast du genomische Sequenzdaten und brauchst Hilfe bei der Variantenidentifikation oder Genannotierung? Ich werde eine klare, gut dokumentierte Genom-Analyse durchführen und Ergebnisse liefern, die du direkt in deiner Forschung oder deiner Abschlussarbeit verwenden kannst.


Was ich anbiete:

  • Qualitätskontrolle und Trimmen der DNA-Sequenz (FastQC, Trimmomatic)
  • Alignierung auf Referenzgenom (BWA, Bowtie2)
  • SNP- und Indel-Varianten-Calling (GATK, bcftools)
  • Varianten-Annotation und Filterung (SnpEff, ANNOVAR)
  • Genfindung und funktionale Annotation (Prokka, BLAST)
  • Manhattan-Plots, Varianten-Zusammenfassungstabellen und schriftlicher Bericht


Alle Skripte (Python/Bash/R) sind enthalten, damit deine Analyse vollständig reproduzierbar ist. Ich arbeite mit menschlichen, pflanzlichen und mikrobiellen Genomen.


Schicke mir vor der Bestellung deine FASTQ- oder VCF-Dateien sowie Organismen-Details.

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do genomics variant calling and gene annotation using gatk
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do genomics variant calling and gene annotation using gatk