Kategorien durchsuchen
Entdecken
Fiverr Pro
Deutsch
$
USD
Ich werde molekulares Docking und MD-Simulation durchführen
Spezialist für Bioinformatik und Computergestützte Biologie
Brauchst du zuverlässige bioinformatische oder rechnergestützte Analysen für deine Forschung?
Ich bin MS Bioinformatiker an der NUST und arbeite in den Bereichen Genomik, rechnergestützte Wirkstofffo...
Über diesen Service
Suchst du zuverlässige molekulare Docking- und Molekulardynamik-Simulationen für deine Forschung im Bereich Wirkstoffentdeckung?
Ich biete umfassende Analyse im Bereich computergestützte Wirkstoffentdeckung, von der Protein- und Liganden-Vorbereitung bis hin zu molekularem Docking, Protein-Ligand-Interaktionsanalyse und GROMACS-Molekulardynamik-Simulationen.
MEINE DIENSTLEISTUNGEN UMFASSEN
- Protein- und Liganden-Vorbereitung
- Protein-Ligand-Molekulardocking
- Molekulardocking mit AutoDock Vina und verwandten Tools
- Bindungsaffinitäts- und Docking-Score-Analyse
- Bewertung der Docking-Pose
- 2D- und 3D-Interaktionsanalyse zwischen Protein und Ligand
- Analyse von Bindungsstellen und wechselwirkenden Residuen
- Virtuelles Screening von Wirkstoffbibliotheken
- Vergleichende Liganden-Rangordnung
- Drug-likeness-Analyse
- ADMET- und Toxizitätsvorhersage
- Molekulardynamik-Simulation mit GROMACS
- RMSD-Analyse
- RMSF-Analyse
- Radius der Gyration (Rg)
- SASA-Analyse
- Hydrogenbrücken-Analyse
- PCA- und Trajektorien-Analyse bei Bedarf
- MM-PBSA-Bindungsfrei-Energie-Analyse bei Anwendung
- Abbildungen und Ergebnis-Tabellen in Publikationsqualität
TOOLS
GROMACS | AutoDock Vina | PyMOL | Chimera/ChimeraX | Discovery Studio | SwissADME | Python | verwandte computergestützte Wirkstoffentdeckung
Art der Dienstleistung:
Recherche
Sprache:
Englisch
Bevorzugte Lieferart
Bitte informiere den Freelancer über alle Präferenzen oder Bedenken in Bezug auf den Einsatz von KI-Tools bei der Ausführung und/oder Lieferung deines Auftrags.
Akademische Arbeiten von anderen erledigen zu lassen ist unethisch, da es gegen die Ehrenkodizes der meisten Bildungseinrichtungen verstößt.
Verkäufer zu bitten, in deinem Namen Hausaufgaben/akademische Arbeiten anzufertigen, verstößt gegen Fiverrs Community-Standard und kann zur Deaktivierung deines Kontos führen.
FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Informationen benötigst du, um mit dem molekularen Docking zu beginnen?
Bitte stelle die Struktur des Zielproteins oder die PDB-ID bereit, Ligandenstrukturen oder Wirkstoffnamen/-IDs, dein Forschungsziel und den erwarteten Bindungsort, falls bekannt. Falls der Bindungsort nicht bekannt ist, erwähne dies vor der Bestellung, damit der passende Workflow besprochen werden kann.
Welche Software verwendest du für Molekulardocking?
Je nach Projekt kann ich AutoDock Vina und verwandte Tools zur Protein- und Liganden-Vorbereitung verwenden. PyMOL, Chimera/ChimeraX, Discovery Studio und ähnliche Software können für die Visualisierung und Interaktionsanalyse genutzt werden.
Führst du Molekulardynamik-Simulationen durch?
Ja. Ich führe GROMACS-basierte Molekulardynamik-Simulationen durch, inklusive Analysen wie RMSD, RMSF, Radius der Gyration, SASA und Wasserstoffbrücken. Zusätzliche Trajektorienanalysen können je nach Forschungsziel integriert werden.
Kannst du 50 ns oder 100 ns MD-Simulationen durchführen?
Ja. MD-Simulationen können je nach Molekularsystem und Studienziel unterschiedlich lang durchgeführt werden. Kontaktiere mich bitte vor der Bestellung längerer Simulationen wie 100 ns oder mehr, damit die Rechenanforderungen geprüft werden können.
Führst du MM-PBSA-Bindungsfrei-Energie-Analysen durch?
Ja. MM-PBSA oder verwandte Bindungsfrei-Energie-Analysen können bei Bedarf für das Molekularsystem und den Simulationsworkflow integriert werden.
Kannst du virtuelles Screening durchführen?
Ja. Ich kann virtuelles Screening gegen ein Zielprotein durchführen. Große Wirkstoffbibliotheken sollten vor der Bestellung besprochen werden, da Preisgestaltung und Lieferung von der Anzahl der Wirkstoffe, Zielproteine und erforderlichen Nachanalysen abhängen.
