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Ich führe RNA-Seq, WGS, WES und NGS Bioinformatik-Analysen durch
Spezialist für Bioinformatik und Computergestützte Biologie
Brauchst du zuverlässige bioinformatische oder rechnergestützte Analysen für deine Forschung?
Ich bin MS Bioinformatiker an der NUST und arbeite in den Bereichen Genomik, rechnergestützte Wirkstofffo...
Über diesen Service
Hast du RNA-seq-, NGS-, WGS- oder WES-Daten, brauchst aber einen klaren und reproduzierbaren bioinformatischen Workflow?
Ich biete professionelle Bioinformatik- und Genomdatenanalyse für Forscher, Studierende und Forschungsteams an, vom rohen Sequenzierungsdaten bis zur bedeutungsvollen biologischen Interpretation.
MEINE DIENSTLEISTUNGEN UMFASSEN
- RNA-seq- und NGS-Datenanalyse
- FASTQ-Qualitätskontrolle und Vorverarbeitung
- Read-Trimming und Filterung
- Ausrichtung und Quantifizierung
- Genexpressionanalyse
- Differenzielle Expressionsanalyse
- PCA, Heatmaps und Volcano-Plots
- WGS- und WES-Datenanalyse
- Variantenerkennung, Filterung und Annotation
- Transcriptomics-Analyse
- GO- und KEGG-Anreicherung
- GSEA- und Pfadanalyse
- Statistische Analyse und Visualisierung
- Öffentliche Datensätze wie GEO und TCGA
- Reproduzierbare bioinformatische Pipelines
- Abbildungs- und Tabellenerstellung für Publikationen
TOOLS
Python | R | Linux | FastQC | MultiQC | STAR | HISAT2 | BWA | SAMtools | featureCounts | DESeq2 | GATK | bcftools und andere projektspezifische bioinformatische Tools.
Sende mir dein Forschungsziel und deine verfügbaren Daten, und ich helfe dir, den passenden Analyse-Workflow zu bestimmen.
FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Arten von Sequenzierungsdaten kannst du analysieren?
Ich kann mit RNA-seq-, WGS-, WES- und anderen NGS-Datensätzen arbeiten. Je nach Projekt kann ich von rohen FASTQ-Dateien, BAM-Dateien, Zählmatrizen, VCF-Dateien oder verarbeiteten genomischen Daten starten.
Kannst du von rohen FASTQ-Dateien starten?
Ja. Ich kann von rohen Sequenzierungsdateien starten und Qualitätskontrolle, Vorverarbeitung, Ausrichtung oder Quantifizierung sowie geeignete Downstream-Analysen durchführen.
Führst du differentiell exprimierte RNA-seq-Analysen durch?
Ja. Der Workflow kann die Generierung von Zählungen, Normalisierung, differentieller Expression, PCA, Heatmaps, Volcano-Plots und biologische Interpretation umfassen.
Führst du WGS- und WES-Analysen durch?
Ja. Je nach Projekt kann die WGS/WES-Analyse QC, Ausrichtung, BAM-Verarbeitung, Variantenerkennung, Filterung, VCF-Verarbeitung und Annotation umfassen.
Kannst du GO-, KEGG- und Pfad-Anreicherung durchführen?
Ja. Funktionale Anreicherung kann GO, KEGG, GSEA oder andere geeignete Pfadanalyse je nach Organismus und verfügbaren Gen-IDs umfassen.
Welche Tools verwenden Sie?
Tools werden entsprechend dem Datensatz und Studiendesign ausgewählt. Gängige Tools sind FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, BWA, SAMtools, featureCounts, DESeq2, GATK und bcftools, zusammen mit Python, R und Linux.
