Ich führe 100 ns 33 Analysen von Molekulardynamik-Simulationen mit GROMACS durch

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Biotechnologe, CADD Bioinformatik und wissenschaftliche Forschung, IP-Forschung

Unterstützung der biowissenschaftlichen Forschung durch computergestützte Wirkstoffentdeckung und bioinformatische Dienste. BTGenZ ist spezialisiert auf molekulares Docking, Molekulardynamik (MD) Simu...
Über diesen Service

Mit GROMACS biete ich Simulationen und eine umfassende 33-Analyse-Suite, abhängig von der Systemtauglichkeit.


Was du bekommst:

  • Strukturelle Stabilität: RMSD, RMSF, Gyrationsradius (Rg), SASA und DSSP.
  • Molekulare Wechselwirkungen: Wasserstoffbrücken, Salzbrücken, hydrophobe Kontakte, ProLIF-Fingerabdrücke, Abstand, Winkel und Dihedralanalyse.
  • Bindungsenergie: MM-PBSA und MM-GBSA.
  • Fortgeschrittene Analyse: PCA, DCCM, Trajektorien-Clustering, freie Energie-Landschaft (FEL) und Ramachandran-Analyse.
  • Zusätzliche Analysen: QC, PBC-Zentrierung, Hydratationsdynamik, RDF, MSD, räumliche Dichte, Taschen-Dynamik, Schnittstellenfläche, Form-Deskriptoren und repräsentative Strukturen, sowie spezielle Analysen, falls anwendbar.
  • Ausgaben: Rohdaten der Simulation, numerische Analyseergebnisse, Diagramme und verarbeitete Strukturen/Trajektorien, wo zutreffend.


Interaktiver HTML-Bericht: 300 $ extra. Beispiel ansehen: https://sujay-19m.github.io/BTGenZ-Molecular-Dynamics-Scientific-Report/


Benötigst du längere Simulationen, Molekulardocking, QSAR oder integrierte CADD-Dienste? Bitte sende mir eine Nachricht für individuelle Preise, bevor du bestellst.

Domäne:

Andere

Expertise:

Andere

Programmiersprache:

Python

Tools:

Andere

Technologie:

Andere

Modelle & Methoden:

Andere

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