Ich werde Bioinformatik, NGS, RNAseq und Transkriptomanalyse durchführen

Hallo, ich bin Shohel Islam, Bioinformatiker und Biotechnologe. Ich werde WGS, RNA-seq, 16s rRNA-seq, ncRNA-seq (miRNA, lncRNA) und Microarray-Daten Analyse im Linux-Terminal und RStudio durchführen. Wenn du Schwierigkeiten hast, NGS-bezogene Projekte zu verstehen, bin ich hier, um dir zu helfen. Ich habe an mehreren Forschungsarbeiten gearbeitet und weiß, welche Daten benötigt werden.

Einige Beispiele meiner Forschungsartikel:

1. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0317008
2. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0319952
3. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0319176
4. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0309353
5. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0298543

Du kannst meine Dienste in folgenden Bereichen in Anspruch nehmen:

• Daten aus der SRA-Datenbank/Personalisierte RNA-Seq-Rohdaten abrufen
• Qualitätskontrolle der Rohdaten (Fastqc)
• Trimmen von schlechten Qualitätsdaten und Adaptern
• Ausrichtung der Rohdaten
• Erstellung der Feature-Count-Matrix
• Normalisierung der Daten (RPKM/FPKM/TPM)
• Differentielle Genanalyse
• Liste der hoch- und runterregulierten Gene
• Vorhersage von nicht-codierenden RNA
• Varianten-Calling & deren Annotation
• Analyse der räumlichen Transkriptomik

Bitte schreib mir zuerst, um zu bestätigen, dass ich in deinem Zeitrahmen verfügbar bin und das machen kann, was du brauchst. Danke!