Ich werde molekulares Docking und virtuelles Screening für die Wirkstoffentwicklung durchführen

Ich helfe Forschern, Startups und Studenten dabei, ein Zielprotein und eine Reihe von Kandidatverbindungen in gerankte, verteidigungsfähige Bindungsvorhersagen umzuwandeln.

Mit AutoDock Vina führe ich strukturorientiertes Molekulardocking durch: Protein- und Ligandenvorbereitung, Gitterboxeinrichtung um die Bindungsstelle, Dockingläufe und Visualisierung der Bindungsposition in PyMOL. Für größere Verbindungssets führe ich Batch-Virtual-Screenings durch und liefere eine gerankte Tabelle der Bindungsaffinitäten, damit du priorisieren kannst, welche Moleküle du experimentell weiterverfolgen möchtest.

Mein Hintergrund liegt in der rechnerischen und physikalischen Chemie (MSc, Physikalische Chemie), mit praktischer Projekterfahrung bei Docking- und Molekulardynamik-Studien, inklusive eines EGFR-Docking- und MD-Workflows. Ich arbeite auch mit GROMACS für MD-Validierungen, sodass ein Docking-Ergebnis mit einer kurzen Simulation auf die Stabilität der Pose überprüft werden kann.

Was du bekommst: eine klare Methodenübersicht, Bilder der Bindungspositionen, eine gerankte Ergebnistabelle für Multi-Ligand-Jobs und ehrliche Kommunikation – ich sage dir offen, wenn dein Ziel oder Ligandensatz bekannte Einschränkungen hat, anstatt nur Ergebnisse zu versprechen, die das Docking allein nicht liefern kann.

Schick mir vor der Bestellung eine Nachricht mit deinem Protein (PDB-ID oder Strukturdatei) und Ligand(en).