Ich führe RNA-Seq, DGE-Analyse, WGCNA und Transkriptomik durch

Ich biete eine gründliche, publikationsfertige Transkriptomik-Analyse vom Rohzählmatrix bis zur biologischen Interpretation mit DESeq2, WGCNA und Pfadwegewertungs-Tools in R und Python an.

Ich biete:

• Differenzielle Expressionsanalyse: DESeq2, limma, edgeR
• WGCNA: Ko-Expressionsnetzwerk-Erstellung, Hub-Gene-Identifikation, Trait-Korrelation
• Pfadwegewertungsanalyse: GO, KEGG, Reactome mit clusterProfiler
• ssGSEA: Immunzellinfiltration und Gen-Set-Bewertung
• GEO-Dataset-Handling: Datenabruf, Vorverarbeitung, Normalisierung
• Visualisierung: Volcano-Plots, Heatmaps, PCA, pheatmap, ggplot2
• Integration in die Wirkstoffforschung oder Netzwerk-Pharmakologie-Pipelines

Fähigkeiten:

• R · DESeq2 · WGCNA · limma · clusterProfiler · ggplot2 · pheatmap
• Python · Pandas · matplotlib · seaborn
• GEO · TCGA · KEGG · Reactome · GO

Warum du mich wählen solltest:

• Praktische Erfahrung mit echten COPD- und Krebs-Transkriptomik-Datensätzen
• Saubere, kommentierte R-Skripte bei jedem Auftrag geliefert
• Abbildungen im Format für Zeitschrifteneinreichungen
• Reaktionsschnell und detailorientiert während des gesamten Projekts
• Komfort im Umgang mit unordentlichen, realen GEO-Datensätzen