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Ich werde Bulk-RNA-Seq-DEG- und Pfadanalyse durchführen
Bioinformatik Genomik R Python ML und Wissenschaftliches Schreiben
Ich bin Saad, Spezialist für Bioinformatik und Computational Biology mit Fokus auf Pflanzen-Genomik, Genomanalyse, RNA-seq, Datenanalyse, R, Python und wissenschaftliches Schreiben. Über Saad Genomics...
Über diesen Service
Willkommen bei meinem Gig,
Suchst du nach genauer, reproduzierbarer und publikationsfertiger Bulk-RNA-Seq-Analyse?
Ich biete maßgeschneiderte Transkriptomdatenanalyse für Forscher, Labore und Biotechnologie-Profis an. Je nach gewähltem Paket kann ich mit Rohdatenmatrix oder FASTQ-Dateien arbeiten.
Die Dienstleistungen können umfassen:
- FASTQ-Qualitätskontrolle und MultiQC-Berichte
- Read-Trimming, Alignment oder Transkript-Quantifizierung
- Gene-Level-Count-Erstellung
- Normalisierung, PCA und Stichprobenkorrelation
- Differenzielle Expressionsanalyse
- Volcano-, MA-Diagramme und Heatmaps
- Gene Ontology und Pfad-Enrichment
- Publikationsfertige Abbildungen und Ergebnis-Tabellen
- R-Skripte und eine klare Interpretationsbericht
Ich nutze etablierte Tools wie FastQC, MultiQC, STAR, HISAT2, Salmon, DESeq2, edgeR und clusterProfiler auf Linux-Umgebung.
Bitte kontaktiere mich vor der Bestellung, wenn du Roh-FASTQ-Dateien, Organismen außerhalb des Modells, komplexe Designs oder mehr als 12 Proben hast. Die Ergebnisse hängen von der Datenqualität und dem experimentellen Design ab.
Mein Portfolio
FAQ
Automatische Übersetzung
Akzeptierst du Roh-FASTQ-Dateien?
Ja. Die Verarbeitung von FASTQ ist im Premium-Paket enthalten oder kann über ein individuelles Angebot erfolgen. Bitte sende vor der Bestellung die Anzahl der Proben, Sequenzierungstyp und ungefähre Dateigröße.
Kannst du eine bestehende Count-Matrix analysieren?
Ja. Bitte stelle die Rohdatenmatrix mit Ganzzahlen, Metadaten der Proben und die gewünschten Vergleiche bereit.
Welche Organismen kannst du analysieren?
Ich kann Pflanzen-, Mikroben-, Tier- und Human-Datensätze analysieren, wenn geeignete Referenzgenome, Transkriptome und Annotationsressourcen vorhanden sind.
Wirst du publikationsfertige Abbildungen bereitstellen?
Ja. Abbildungen können im PNG-, TIFF-, PDF- oder SVG-Format geliefert werden, je nach gewähltem Paket und Veröffentlichungsanforderungen.
Wirst du den Analyse-Code bereitstellen?
Analyse-Skripte sind in den Standard- und Premium-Paketen enthalten. Sie können auch als Extra zum Basic-Paket hinzugefügt werden.
Garantierst du signifikante Gene oder Pfade?
Nein. Die Ergebnisse hängen von der Datenqualität, Sequenzierungstiefe, biologischer Variation und dem experimentellen Design ab. Ich biete transparente Analysen ohne Manipulation oder Fälschung der Ergebnisse an.
