Ich werde Docking durchführen und fortgeschrittene molekulardynamische Simulationen ausführen

Suchen Sie nach professionellen Dienstleistungen im Bereich Molekulardynamik-Simulation (MD) und Molekulardocking für Ihr Forschungsprojekt, Ihre Publikation oder Ihre Wirkstoffforschung? Dann sind Sie hier genau richtig!

Mit fundierten Kenntnissen in Computerbiologie und Chemie biete ich umfassende MD-Simulationen und fortgeschrittene Analysen unter Verwendung von branchenüblichen Tools wie GROMACS, AMBER, BIO3D und anderen an.

Meine Dienstleistungen:

Molekulares Docking:

• Protein-Ligand-Docking
• Docking-Score-Analyse
• Visualisierung der Bindungspose

Molekulardynamiksimulation (MDS): (Protein-Ligand, Protein-Protein, Protein-DNA/RNA)

• Vollständige MD-Pipeline
• Simulationen bis zu 2000 ns oder mehr mit GROMACS

Post-MD-Analyse:

• RMSD
• RMSF
• Rg
• SASA & Buried SASA
• Wasserstoffbrücke
• Protein-Ligand-Abstand
• Sekundärstrukturanalyse
• Hauptkomponentenanalyse (mit Bio3D)
• FEL (Freie Energielandschaft)
• DCCM
• Stachelschwein-Plätze
• 3D-korrelierte und antikorrelierte Bewegungsnetzwerke
• MMGBSA und MMPBSA
• Analyse der Zersetzungsenergie pro Rest
• MDS-Video

Verwendete Werkzeuge und Software:

GROMACS | AMBER | BIO3D | VMD | PyMOL | UCSF Chimera | AutoDock | MMGBSA/MMPBSA | MDAnalysis | Schrödinger | PyRx | BIOVIA Discovery Studio | XMGrace