Ich werde molekulare Docking- und Molekulardynamik-Simulationen durchführen

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Computational Chemist DFT-Berechnungen und Molekulardynamik

Ich bin Forscher im Bereich der Computational Chemistry mit Erfahrung in DFT-Berechnungen, Molekülmodellierung und Molekulardynamik (MD)-Simulationen. Meine Forschungsinteressen umfassen Elektronenzus...
Über diesen Service

Ich biete professionelle Molecular-Dynamics-(MD)-Simulationsdienstleistungen mit GROMACS für computationale Biologie, Wirkstoffforschung und Protein–Ligand-Interaktionsstudien an. Mein Fokus liegt darauf, Protein-Stabilität, molekulare Wechselwirkungen und strukturelle Dynamik durch verlässliche Rechenworkflows und wissenschaftliche Analysen zu verstehen.


Meine Leistungen umfassen

  1. MD-Simulationsaufbau: Vorbereitung von Protein- und Protein-Ligand-Systemen, Wahl des Kraftfelds, Solvation, Ionen hinzufügen, Energie-Minimierung und Gleichgewicht.
  2. Molekulardynamik-Simulation: Produktions-MD-Simulationen zur Untersuchung von Protein-Stabilität, Konformationsänderungen und Protein-Ligand-Wechselwirkungen.
  3. Trajektorien-Analyse: RMSD, RMSF, Radius der Gyration (Rg), solvatationsabhängige Oberflächenfläche (SASA), Wasserstoffbrückenanalyse und Beurteilung der strukturellen Stabilität.
  4. Wissenschaftliche Berichterstattung: Publikationsreife Diagramme, molekulare Visualisierung, Ergebnisinterpretation und organisierte Rechen-Daten.


Werkzeuge und Software

GROMACS, PyMOL, UCSF Chimera und verwandte Tools zur molekularen Analyse, je nach Projektanforderungen.

Liefergegenstände

  • MD-Trajektorien-Analyse-Diagramme und Abbildungen
  • Strukturanalyse und Interaktionsbericht


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