Ich werde Bioinformatik-Pipelines für rnaseq und metagenomics durchführen

Egal, ob du einen maßgeschneiderten RNA-Seq-Workflow, eine mikrobiologische Diversitätsanalyse oder eine Multi-Omics-Pipeline von Grund auf neu benötigst, ich entwickle reproduzierbare, skalierbare bioinformatische Lösungen, die auf deine Daten zugeschnitten sind. Mit praktischer Erfahrung in HPC und Linux erstelle ich saubere, gut dokumentierte Workflows, damit du dich auf die Wissenschaft konzentrieren kannst, nicht auf den Code.

Was ich für dich tun kann: Vom Rohdatensatz bis zu den Endergebnissen kümmere ich mich um die vollständige Pipeline, Qualitätskontrolle, Trimmen, Ausrichtung, Quantifizierung, differentielle Expression und Visualisierung. Bei Metagenomics decke ich taxonomische Profilierung, Alpha/Beta-Diversität und mikrobiologische Gemeinschaftsanalyse ab.

Tools & Software: Ich arbeite mit branchenüblichen Tools wie FastQC, Trimmomatic, HISAT2, DESeq2, STAR, QIIME2, Kraken2, Bash/Linux, SLURM und R, um sicherzustellen, dass deine Pipeline sowohl leistungsstark als auch reproduzierbar ist.

Warum mit mir zusammenarbeiten: Jede Pipeline wird mit sauberer Dokumentation und einer README geliefert, damit dein Team sie warten und wiederverwenden kann. Skripte sind für HPC-Cluster optimiert, skalierbar für große Datensätze und vollständig reproduzierbar. Egal, ob du Forscher, Biotech-Startup oder klinisches Labor bist, ich liefere Ergebnisse, auf die du vertrauen und aufbauen kannst.