Ich erstelle einen phylogenetischen Baum und analysiere deine amr-Gens sequences
Bioinformatik-Analyst, Spezialist für AMR und Phylogenetik
Über diesen Service
Hast du Schwierigkeiten, die evolutionären Beziehungen deiner antimikrobiellen Resistenz (AMR)-Gene zu visualisieren? Ich bin Master-Student in Biochemie und Molekularbiologie mit praktischer Erfahrung in der molekularen Diagnostik im öffentlichen Gesundheitswesen. Ich kombiniere mein tiefgehendes biologisches Verständnis mit automatisierten Bioinformatik-Pipelines, um dir eine publication-ready phylogenetische Analyse zu liefern.
Was ich für dich mache:
- Automatisierte Sequenzbeschaffung von NCBI (oder Arbeit mit deinen bereitgestellten FASTA-Dateien).
- Multiple Sequenzalignment mit Clustal Omega.
- Phylogenetischer Baum (Neighbor-Joining) mit 100 Bootstrap-Replikaten.
- Ein klarer, einseitiger PDF-Bericht, der die biologische Bedeutung interpretiert (z.B. Hinweise auf horizontalen Gentransfer oder klonale Expansion).
Warum du mich wählen solltest?
Ich klicke nicht nur Buttons in Software. Ich schreibe Python-Skripte (Biopython), die sicherstellen, dass deine Analyse reproduzierbar und schnell ist. Mein Hintergrund im Labor bei Antibiotika-Suszeptibilitätstests (AST) und PCR bedeutet, dass ich den klinischen Kontext deiner Resistenzgene verstehe, nicht nur den Code.
Lieferumfang:
- Ein hochauflösendes Baum-Bild.
- Die ausgerichtete FASTA-Datei.
- Ein PDF-Bericht mit vollständiger Methodik und Interpretation.
Programmiersprache:
Python
Technologie:
Jupyter-Notizbuch
Analyse-Typ:
statistische Analyse
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Prädiktive Analyse
Expertise:
Algorithmen
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Statistiken
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Cluster-Analyse
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Andere
Tools:
Jamovi
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Google Colab
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Microsoft Excel

