Ich erstelle einen phylogenetischen Baum und analysiere deine amr-Gens sequences

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Bioinformatik-Analyst, Spezialist für AMR und Phylogenetik

Ich unterstütze Forscher dabei, ihre Daten effizient zu analysieren, indem ich meine Expertise in Molekularbiologie im Labor mit computationaler Bioinformatik kombiniere. Als Master-Student in Biochem...
Über diesen Service

Hast du Schwierigkeiten, die evolutionären Beziehungen deiner antimikrobiellen Resistenz (AMR)-Gene zu visualisieren? Ich bin Master-Student in Biochemie und Molekularbiologie mit praktischer Erfahrung in der molekularen Diagnostik im öffentlichen Gesundheitswesen. Ich kombiniere mein tiefgehendes biologisches Verständnis mit automatisierten Bioinformatik-Pipelines, um dir eine publication-ready phylogenetische Analyse zu liefern.


Was ich für dich mache:

  • Automatisierte Sequenzbeschaffung von NCBI (oder Arbeit mit deinen bereitgestellten FASTA-Dateien).
  • Multiple Sequenzalignment mit Clustal Omega.
  • Phylogenetischer Baum (Neighbor-Joining) mit 100 Bootstrap-Replikaten.
  • Ein klarer, einseitiger PDF-Bericht, der die biologische Bedeutung interpretiert (z.B. Hinweise auf horizontalen Gentransfer oder klonale Expansion).

Warum du mich wählen solltest?

Ich klicke nicht nur Buttons in Software. Ich schreibe Python-Skripte (Biopython), die sicherstellen, dass deine Analyse reproduzierbar und schnell ist. Mein Hintergrund im Labor bei Antibiotika-Suszeptibilitätstests (AST) und PCR bedeutet, dass ich den klinischen Kontext deiner Resistenzgene verstehe, nicht nur den Code.


Lieferumfang:

  • Ein hochauflösendes Baum-Bild.
  • Die ausgerichtete FASTA-Datei.
  • Ein PDF-Bericht mit vollständiger Methodik und Interpretation.

Programmiersprache:

Python

Technologie:

Jupyter-Notizbuch

Analyse-Typ:

statistische Analyse

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Prädiktive Analyse

Expertise:

Algorithmen

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Statistiken

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Cluster-Analyse

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Andere

Tools:

Jamovi

•

Google Colab

•

Microsoft Excel

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