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Ich werde NGS-Datenanalyse durchführen
Bioinformatiker
Ich biete NGS-Datenanalyse-Dienste an, spezialisiert auf die Umwandlung roher Sequenzierungsdaten (FASTQ) in hochwertige Varianten-Ergebnisse (VCF).
Mein Workflow umfasst:
Qualitätskontrolle von FAST...
Über diesen Service
Ich biete professionelle NGS-Datenanalyse-Dienste an, spezialisiert auf die Umwandlung roher Sequenzierungsdaten (FASTQ) in hochwertige Varianten-Ergebnisse (VCF).
Ich werde eine vollständige und zuverlässige Pipeline mit Standard-Bioinformatik-Tools durchführen.
Was ich machen werde:
- Qualitätskontrolle von FASTQ (FastQC, fastp)
- Sequenz-Ausrichtung mit BWA
- BAM-Verarbeitung mit SAMtools
- Varianten-Calling mit GATK
- Sauberes und reproduzierbares VCF-Output
Was du bekommst:
- Verarbeitete BAM-Dateien
- Endgültige VCF-Datei
- Zusammenfassung der durchgeführten Schritte
️ Wichtig:
- Geeignet für Forschungs- und akademische Datensätze
- Große Datensätze können zusätzliche Zeit/Ressourcen erfordern
Wenn du spezielle Anforderungen hast, kontaktiere mich gerne vor der Bestellung.
Technologie:
Jupyter-Notizbuch
•
RStudio
Expertise:
Prognose
Programmiersprache:
Python
•
R
•
SQL
FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Daten benötigen Sie?
FASTQ-Dateien und Referenzgenom (falls verfügbar)
Können Sie mit großen Datensätzen umgehen?
Ja, aber große Datensätze können zusätzliche Zeit oder Ressourcen erfordern.
Welche Werkzeuge verwenden Sie?
BWA, SAMtools, GATK, FastQC und fastp.
Wirst du eine Interpretation liefern?
Grundlegende Interpretation ist im Premium-Paket enthalten.
