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Ich werde Bioinformatik RNA-Seq DNA-Seq Analyse und Variantenbestimmung durchführen
LLM Entwickler
Bei Nodeable.ai arbeite ich als AI-Entwickler, konzentriere mich auf AI-Automatisierung und entwickle fortschrittliche AI-Sprachagenten-Technologien. Meine Expertise umfasst den Einsatz von FastAPI fü...
Über diesen Service
Brauchst du zuverlässige, publikationsfertige Bioinformatik-Analysen? Du bist hier genau richtig.
Ich biete End-to-End NGS-Analysen für RNA-Seq und DNA-Seq an, inklusive vollständiger Variantenbestimmung und Annotation, nach GATK Best Practices und aktuellen Gold-Standard-Tools.
RNA-Seq: Qualitätskontrolle, Trimmen, Ausrichtung (STAR / HISAT2 / Salmon), Quantifizierung, differentieller Ausdruck (DESeq2 / edgeR) und funktionale Anreicherung (GO / KEGG / GSEA) mit PCA, Volcano-Diagrammen und Heatmaps.
DNA-Seq & Variantenanalyse: Ausrichtung (BWA-MEM), Duplikat-Markierung, BQSR, Variantenbestimmung (GATK HaplotypeCaller / Mutect2 / DeepVariant / bcftools) plus Annotation (VEP / ANNOVAR / SnpEff) und gefilterte, priorisierte Varianten-Tabellen.
Du erhältst saubere, reproduzierbare Ergebnisse: verarbeitete Dateien, annotierte Tabellen, hochauflösende Abbildungen und eine klare Methodenübersicht, die du direkt in eine Arbeit oder einen Bericht einfügen kannst.
Ich arbeite mit menschlichen, Modell- und Nicht-Modell-Organismen in Keimbahn- und somatischen Studien.
Neues Projekt oder unsicher, was du brauchst? Schreib mir zuerst und ich erstelle den genauen Ablaufplan und ein Angebot für deine Daten.
Mein Portfolio
FAQ
Automatische Übersetzung
Muss ich die Rohdaten bereitstellen?
Ja — FASTQ ist ideal, aber ich kann auch mit BAM/VCF starten. Ich kann auch öffentliche Daten von SRA/GEO ziehen, wenn du Zugangs-IDs hast.
Welche Organismen unterstützt du?
Mensch, gängige Modellorganismen und Nicht-Modellarten (ich erstelle eine benutzerdefinierte Referenz, wenn keine Standardannotation vorhanden ist).
Kannst du somatische / Tumor-normal Variantenbestimmung durchführen?
Ja — Mutect2-basierte somatische Pipelines neben standardmäßigen Keimbahn-HaplotypeCaller-Workflows.
Werden die Ergebnisse reproduzierbar sein?
Jede Bestellung enthält dokumentierte Schritte; füge die Pipeline-Option für vollständig skriptgesteuerte Nextflow/Snakemake-Reproduzierbarkeit hinzu.
Werden meine Daten vertraulich behandelt?
Ja. Die Daten werden nur für deine Analyse verwendet und nach Wunsch nach Lieferung gelöscht.
