Über 3 Jahre spezialisierte Erfahrung in bakterieller Genomik, Bioinformatik und KI/ML-Integration
End-to-End-Pipelines für bakterielle Genomassemblierung, Annotation und vergleichende Genomik entwickelt
Praktische Erfahrung mit Tools wie BLAST, MEGA, iTOL, BPGA und Datenbanken wie NCBI, EnsemblBacteria gesammelt
Angebotene Dienstleistungen Bakterielle Genomanalyse
- Umfassende bakterielle Genomanalyse mit BLAST, MEGA, iTOL und Pan-Genom-Tools (z.B. BPGA)
- Erstellung und Annotation von phylogenetischen Bäumen und Visualisierung mit iTOL
- Pan-Genom-Profiling (Kern-, Accessory- und Unique-Gene-Analyse) über mehrere Bakterienstämme
- Integration und Analyse von GEO-Datensätzen für bakterielle Transkriptomik
- Enrichment-Analyse (GO/KEGG) zur funktionellen Interpretation von Bakterien-Gene-Sets
- Entwicklung von maßgeschneiderten ML-Pipelines, um Biomarker, Resistenzgene oder evolutionäre Muster zu identifizieren
- Skalierbare Pipelines für vergleichende Genomik, Drug-Target-Discovery und mikrobielle Klassifikation