Ich werde molekulares Docking und MD-Simulationsanalyse durchführen

Benötigst du eine präzise molekulare Docking- oder MD-Simulation mit Ergebnissen, die du tatsächlich interpretieren und verteidigen kannst?

Ich habe einen MS in Molekulare Virologie und einen BS in Bioinformatik. Meine Abschlussarbeit umfasste virtuelles Screening, molekulares Docking und molekulare Dynamik-Simulationen, um Kandidat-Inhibitoren gegen krankheitsrelevante Proteinziele zu bewerten. Ich verstehe die Biologie hinter den Zahlen, nicht nur, wie man die Software bedient.

Tools, mit denen ich arbeite:

• AutoDock Vina, Discovery Studio (molekulares Docking und virtuelles Screening)
• GROMACS (molekulare Dynamik-Simulation)
• PyMOL und UCSF Chimera, Chimera X (strukturelle Visualisierung)

Ich biete an:

• Virtuelles Screening von Wirkstoffbibliotheken gegen ein Ziel
• Protein-Ligand-Docking mit Visualisierung der Bindungspose
• Analyse von 2D- und 3D-Wechselwirkungen
• MD-Simulation (typischerweise bis zu 10-20 ns) mit RMSD-, RMSF-, H-Brücken- und Gyrationsradius-Analyse
• Klare schriftliche Berichte, die Methodik und Ergebnisse erklären

Schreib mir vor der Bestellung, um dein Ziel, Ligand(en) und das passende Paket zu besprechen. Größere Systeme oder längere Simulationen können als individuelle Bestellung vereinbart werden.