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Ich werde Bulk-RNA-Seq- und Genexpressionsdaten analysieren
Bioinformatik-Analyst RNA-Seq Wissenschaftliche Datenvisualisierung
Bioinformatik-Analyst, spezialisiert auf menschliches Bulk-RNA-seq, Genexpressionsanalyse und wissenschaftliche Datenvisualisierung. Ich unterstütze Forscher dabei, Count-Matrizen und Metadaten in kla...
Über diesen Service
Verwandle deine menschlichen Bulk-RNA-seq- oder Genexpressionsdaten in klare, zuverlässige und publikationsfertige Ergebnisse.
Ich unterstütze Forscher, Labore und Biotech-Teams dabei, komplexe Expressionsmatrizen in gut organisierte biologische Erkenntnisse umzuwandeln, indem ich R- und Bioconductor-Workflows verwende, die auf das jeweilige Studien-Design zugeschnitten sind.
Die Dienstleistungen können umfassen:
- Überprüfung von Input, Metadaten und Probenidentität
- Qualitätskontrolle, Bibliotheksgrößenüberprüfung, PCA und Proben-Diagnostik
- Filterung, Normalisierung und Differential-Expression-Analyse
- Komplette Ergebnis-Tabellen, Volcano-Plots und publikationsfertige Abbildungen
- DEG-Heatmaps sowie GO-, Reactome- und KEGG-Pfadanalysen
- Sensitivitäts- und Übereinstimmungsanalysen für fortgeschrittene Projekte
- Klare Methoden, Ergebniszusammenfassung und strukturierte QA-Dokumentation
Du erhältst sorgfältig organisierte Outputs, die leicht zu überprüfen, zu interpretieren und in Berichte, Präsentationen, Manuskripte oder Folgeanalysen zu verwenden sind. Ich lege Wert auf statistische Klarheit, hochwertige Visualisierung und klare Kommunikation während des gesamten Projekts.
Bitte schreibe mir vor der Bestellung, damit ich deine Daten, Forschungsfrage und gewünschte Vergleiche verstehen kann.
Mein Portfolio
FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Dateien muss ich bereitstellen?
Bitte stelle eine Gen-Level-Zähl- oder Expressionsmatrix, Metadaten der Proben, Gruppenzuordnungen, Gen-ID-Typ und die gewünschten Vergleiche bereit. Eine kurze Beschreibung deiner Forschungsfrage ist ebenfalls hilfreich.
Verarbeitest du Roh-FASTQ-Dateien?
Dieses Gig konzentriert sich auf die Downstream-Analyse von Gen-Level-Zählmatrizen oder validierten Expressionsmatrizen. Rohdaten im FASTQ-Format, Qualitätssicherung, Alignment und Quantifizierung erfordern einen separaten, maßgeschneiderten Umfang.
Welches Paket soll ich wählen?
Grundversion umfasst fokussierte QC und Differential-Expression. Standard beinhaltet Diagnostik, DEG-Heatmap und Pfadanalysen. Premium unterstützt größere Studien, bis zu zwei Kontraste, Sensitivitätsanalysen und erweitertes QA.
Sind R- oder Python-Skripte enthalten?
Reproduzierbare R- oder Python-Skripte und Notebooks sind standardmäßig nicht enthalten. Sie können nach Prüfung der Daten, Umgebung und des erforderlichen Code-Umfangs als kostenpflichtiges Extra bereitgestellt werden.
Kannst du gepaarte oder komplexe Studiendesigns analysieren?
Ja, einfache gepaarte und ungepaarte Vergleiche werden im entsprechenden Paket unterstützt. Multi-Faktor-, Interaktions-, Längsschnitt- oder andere komplexe Designs erfordern eine Machbarkeitsprüfung und ein individuelles Angebot.
Kannst du signifikante Gene oder Pfade garantieren?
Statistische Signifikanz hängt von den Daten, der Stichprobengröße und dem biologischen Effekt ab. Ich liefere vollständige, transparente Ergebnisse und berichte sowohl signifikante als auch nicht-signifikante Befunde klar.
Was bekomme ich?
Je nach Paket erhältst du organisierte Ergebnis-Tabellen, hochauflösende Abbildungen, Methoden, eine Ergebniszusammenfassung und QA-Dokumentation. Fortgeschrittene Pakete beinhalten Pfad- und Sensitivitätsanalysen.
Was umfasst eine Revision?
Eine Revision umfasst Korrekturen, Formatierungsänderungen oder Klarstellungen innerhalb des vereinbarten Analyseumfangs. Neue Datensätze, Vergleiche, Methoden oder Analyse-Module erfordern ein individuelles Extra oder Angebot.
