Ich werde Single-Cell-RNA-Seq-Analyse durchführen und Zelltyp-Annotation vornehmen

Hast du Single-Cell-RNA-Seq-Daten, die eine professionelle Analyse und Zelltyp-Identifikation benötigen?

Ich werde dein scRNA-seq-Datensatz mit Seurat analysieren

und eine vollständige Zelltyp-Annotation mit

publikationsfertigen Visualisierungen liefern.

WAS DU BEKOMMST:

- Qualitätskontrolle und Filterung von Zellen mit niedriger Qualität

- Normalisierung und Skalierung

- PCA-Dimensionenreduktion

- Graph-basierte Clusterbildung

- UMAP-Visualisierung

- Marker-Gen-Identifikation pro Cluster

- Biologische Zelltyp-Annotation

- Vollständiger Analysebericht

MEINE ERFAHRUNG:

Ich habe 2700 menschliche PBMCs analysiert und 9 unterschiedliche

Zellpopulationen identifiziert, darunter T-Zellen, B-Zellen, NK-Zellen,

Monozyten, Dendritische Zellen und Thrombozyten, mit Seurat.

Vollständiger Pipeline auf GitHub verfügbar.

WAS ICH VON DIR BRAUCHE:

- 10X Genomics-Ausgabedateien (Barcodes, Features, Matrix)

 ODER verarbeitete Count-Matrix

- Organismenname (Mensch, Maus usw.)

- Jegliche bekannte Biologie deines Samples

TOOLS: R, Seurat, ggplot2, dplyr, UMAP,

    PCA, Git, Linux

Sende mir vor der Bestellung eine Nachricht, um dein Dataset zu besprechen

Ich werde die Machbarkeit zuerst bestätigen.