Ich werde RNA-seq-Differenzialexpressionsanalyse an deinem Datensatz durchführen
Bioinformatik-Pipeline-Entwickler
Über diesen Service
Bist du Forscher oder Wissenschaftler mit RNA-seq-Daten
und brauchst eine professionelle Analyse?
Ich werde dein RNA-seq-Datensatz analysieren und
unterscheiden, welche Gene unterschiedlich exprimiert werden, mit DESeq2, und dir Ergebnisse liefern, die bereit für die Veröffentlichung sind.
WAS ICH BIETE:
- Ausrichtung an Referenzgenom mit HISAT2
- Analyse der differentiellen Expression mit DESeq2
- Volcano-Plot und Heatmap der Top-DEGs
- Vollständiger HTML-Analysebericht
- Saubere, dokumentierte R- und Python-Skripte
LIEFERUMFANG:
- DESeq2-Ergebnisse der differentiellen Expression
- GO-Biologischer-Prozess-Anreicherungsanalyse
- Reactome-Pfadweganalyse mit klinischen Pfaden
- Veröffentlichungsfertige Abbildungen
- Vollständiger HTML-Bericht
MEINE ERFAHRUNG:
Ich habe eine komplette RNA-seq-Pipeline aufgebaut, die echte
Brustkrebs-Genomdaten aus dem NCBI-Datensatz
PRJNA432903 analysiert. Dabei wurden 2298 signifikante DEGs identifiziert, wobei PC1 86 % der Varianz erklärt.
WAS ICH VON DIR BRAUCHE:
- Rohdaten im FASTQ-Format oder vorverarbeitete Zählmatrix
- Referenzgenom oder Organismenname
- Experimentelle Bedingungen und Probeninformationen
VERWENDETE TOOLS:
R, DESeq2, HISAT2, featureCounts, Python, Bash,
Git, Linux, ggplot2, EnhancedVolcano
Bestelle jetzt und erhalte genaue, reproduzierbare
bioinformatische Ergebnisse, die geliefert werden am
Expertise:
Prädiktive Analyse
Programmiersprache:
Python
•
R
Frameworks:
Panda
Tools:
Jupyter-Notizbuch
•
Colab
•
RStudio

