Ich werde RNA-seq-Differenzialexpressionsanalyse an deinem Datensatz durchführen

Einige Informationen wurden automatisch übersetzt.

Sambia

Ich spreche Englisch

Bioinformatik-Pipeline-Entwickler

Ich erstelle reproduzierbare bioinformatische Pipelines für NGS-Datenanalysen, spezialisiert auf RNA-seq-Differenzialexpression und Krebsgenomik. Aktuelles Projekt: RNA-seq-Pipeline für den NCBI-Brus...
Über diesen Service

Bist du Forscher oder Wissenschaftler mit RNA-seq-Daten

und brauchst eine professionelle Analyse?


Ich werde dein RNA-seq-Datensatz analysieren und

unterscheiden, welche Gene unterschiedlich exprimiert werden, mit DESeq2, und dir Ergebnisse liefern, die bereit für die Veröffentlichung sind.


WAS ICH BIETE:

- Ausrichtung an Referenzgenom mit HISAT2

- Analyse der differentiellen Expression mit DESeq2

- Volcano-Plot und Heatmap der Top-DEGs

- Vollständiger HTML-Analysebericht

- Saubere, dokumentierte R- und Python-Skripte

LIEFERUMFANG:

- DESeq2-Ergebnisse der differentiellen Expression

- GO-Biologischer-Prozess-Anreicherungsanalyse

- Reactome-Pfadweganalyse mit klinischen Pfaden

- Veröffentlichungsfertige Abbildungen

- Vollständiger HTML-Bericht

MEINE ERFAHRUNG:

Ich habe eine komplette RNA-seq-Pipeline aufgebaut, die echte

Brustkrebs-Genomdaten aus dem NCBI-Datensatz

PRJNA432903 analysiert. Dabei wurden 2298 signifikante DEGs identifiziert, wobei PC1 86 % der Varianz erklärt.


WAS ICH VON DIR BRAUCHE:

- Rohdaten im FASTQ-Format oder vorverarbeitete Zählmatrix

- Referenzgenom oder Organismenname

- Experimentelle Bedingungen und Probeninformationen


VERWENDETE TOOLS:

R, DESeq2, HISAT2, featureCounts, Python, Bash,

Git, Linux, ggplot2, EnhancedVolcano


Bestelle jetzt und erhalte genaue, reproduzierbare

bioinformatische Ergebnisse, die geliefert werden am

Expertise:

Prädiktive Analyse

Programmiersprache:

Python

R

Frameworks:

Panda

Tools:

Jupyter-Notizbuch

Colab

RStudio

Verwandte Tags