Ich werde RNA-seq, ATAC-seq oder scRNA-seq Analyse mit vollständiger Bioinformatik durchführen

Suchst du nach sauberer, aufschlussreicher und reproduzierbarer Analyse deiner Sequenzierungsdaten?

Ich spezialisiere mich auf Hochdurchsatz-Datenanalyse, einschließlich RNA-seq, ATAC-seq und Single-Cell RNA-seq (scRNA-seq). Egal, ob du mit Bulk-Proben oder komplexen Single-Cell-Datensätzen arbeitest, ich kann dir eine umfassende Pipeline vom Qualitätskontrolle bis zur fortgeschrittenen Nachanalyse bieten.

Ich biete an:

• Qualitätskontrolle (FastQC, MultiQC)
• Ausrichtung & Quantifizierung
• Unterschiedliche Expressions- oder Zugänglichkeitsanalyse
• Peak-Calling (für ATAC-seq)
• Dimensionsreduktion, Clusterbildung, Zelltypbestimmung (für scRNA-seq)
• Visualisierung (Heatmaps, PCA, Volcano-Plots, UMAP/tSNE)
• Funktionelle Anreicherung (GO/KEGG)
• Individuelle Diagramme für Veröffentlichungen

Tools, die ich verwende: R, Seurat, DESeq2, edgeR, MACS2, Galaxy, Bioconductor, Scanpy

Lass uns deine Rohdaten in biologische Erkenntnisse verwandeln!