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Ich werde TCGA GEO und öffentliche Krebs-Transcriptomik-Daten analysieren
PhD Bioinformatiker, RNA-Seq, Genomik, Biostatistik, R und Python
Ich bin Bioinformatiker mit einem PhD in Bioinformatik und über 11 Jahren Erfahrung in der computergestützten Biologie. Ich nutze R und Python für Bulk- und Single-Cell-RNA-seq, ATAC-seq, WGS/WES, TCG...
Level 1
Hat bestimmte Leistungskriterien erfüllt und zeigt großes Potenzial auf dem Marktplatz.
Über diesen Service
Ich analysiere öffentliche Krebs-Transcriptomik-Datensätze aus TCGA, GEO und ähnlichen Forschungsdatenbanken.
Die Dienstleistungen können die Überprüfung von Datensätzen und Metadaten, Expressionsvorverarbeitung, differentielle Expression, Überlebensanalyse, klinische Variablen-Assoziationen, Gen-Korrelationen, Pfadwegerweiterung, Immun- oder molekulare Untergruppenvergleiche und Validierung über Kohorten hinweg umfassen. Der Workflow wird an die Forschungsfrage und die verfügbaren Informationen in jedem Datensatz angepasst.
Du erhältst die vereinbarten Abbildungen und Ergebnistabellen, reproduzierbaren R- oder Python-Code, wo anwendbar, sowie eine knappe Interpretation, die die wichtigsten Ergebnisse und Einschränkungen darlegt.
Dieser Service ist nur für Forschungs- und Bildungszwecke gedacht. Er bietet keine klinische Diagnose, Behandlungsempfehlungen oder patientenspezifische medizinische Interpretation.
Bitte schreibe mir vor der Bestellung eine Nachricht mit dem Krebsart, Dataset-Accession oder Studie, interessierenden Genen oder Pfaden, geplanten Vergleichen und benötigten Ausgaben.
Mein Portfolio
FAQ
Automatische Übersetzung
Kannst du bei der Auswahl eines geeigneten TCGA- oder GEO-Datensatzes helfen?
Ja. Sende die Krebsart, die biologische Fragestellung, die Anforderungen an die Proben und den bevorzugten Datentyp, damit ich geeignete öffentliche Kohorten bewerten kann.
Welche Analysen können enthalten sein?
Der Umfang kann differenzielle Expression, Überlebensanalyse, Korrelation, Anreicherung, Untergruppenvergleich, klinische Variablen-Assoziationen und Validierung über Kohorten hinweg umfassen.
Werde ich den Analyse-Code erhalten?
Ja, wenn im ausgewählten Paket Code enthalten ist. Ich kann reproduzierbare R- oder Python-Skripte, Notebooks und Ergebnistabellen bereitstellen.
Bietest du klinische Interpretation an?
Nein. Dieser Gig bietet Forschungs-Bioinformatik-Analysen und keine Diagnosen, Behandlungsempfehlungen oder patientenspezifische medizinische Interpretation.
