Ich werde Bulk- und Single-Cell-RNA-Seq-Bioinformatikanalyse durchführen

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julia_nuzhnenko
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Juliia N
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do bulk and single cell rna seq bioinformatics analysis
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Über diesen Service

Automatische Übersetzung

Ich bin Bioinformatiker und biete RNA-seq-Analysen mit branchenüblichen Tools wie DESeq2, Scanpy und Cytoscape an, keine automatisierten Black-Box-Pipelines. Jedes Skript wird vor der Lieferung manuell ausgeführt und überprüft, damit die Ergebnisse genau sind und für deine Thesis, Dissertation oder dein Manuskript bereitstehen.


GRUNDLAGEN: Bulk RNA-Seq Differential Expression

DESeq2-Analyse basierend auf deiner Rohdaten-Tabelle. Du erhältst ein Volcano-Plot, eine Heatmap der wichtigsten Gene, eine Excel-Tabelle mit Log2FC und angepassten p-Werten sowie einen kurzen Methodentext. Fertig für die Veröffentlichung, 300dpi.


STANDARD + Protein-Protein-Interaktionsnetzwerk

Alles wie bei Basic, plus ein STRING-basiertes Protein-Interaktionsnetzwerk in Cytoscape, mit Hub-Gene-Identifikation (cytoHubba) und einer Tabelle deiner Top 10 Hub-Gene.


PREMIUM: Single-Cell-RNA-Seq-Analyse

Vollständiger Single-Cell-Workflow in Scanpy: Qualitätskontrolle, Clustering und UMAP-Visualisierung. Zelltypen werden anhand echter Marker-Gene ausgegeben, niemals geraten. Enthält UMAP-Plot, Violinplots für Marker-Gene und eine Marker-Gene-Tabelle pro Cluster.


Ich bestätige immer, dass die Namen der Proben in deinen Dateien übereinstimmen, bevor ich starte, um Fehler in deinen Ergebnissen zu vermeiden.

  • Anwendung

    • RStudio

  • Diagrammtyp

    • Vergleich
    • Konzept
    • Standort
    • Balkendiagramm
    • Insights
    • Analytics
    • Heatmap

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Juliia N

Bioinformatics Specialist for Genomics, Microbiome and Drug Discovery

  • AusPolen
  • Mitglied seitAug. 2026
  • ⌀ Antwortzeit1 Stunde

  • Sprachen

    Polnisch, Ukrainisch, Russisch, Englisch
Bioinformatics specialist with an MSc and a strong academic focus on microbiology and biochemistry. I work with differential gene expression (DESeq2), single-cell analysis (Scanpy), microbiome profiling (phyloseq/vegan), molecular docking (AutoDock Vina), clinical variant annotation (Ensembl VEP), and publication-ready visualization — all built and tested in RStudio/Python with full reproducibility. Co-Founder & CSO of Forneus Technologies, leading biological data strategy for our bioinformatics and AI-driven HealthTech tools.

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