Ich werde Einzelzell-RNA-Sequenzdaten und räumliche Transkriptomik-Daten analysieren

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Ich spreche Deutsch, Englisch

10 Aufträge abgeschlossen

Einfache Lösungen für komplexe biomedizinische Daten

Hallo, mein Name ist Jonathan Alles. Ich bin unabhängiger Berater für Bioinformatik und Datentechnik. Über meine Agentur EVOBYTE Digital Biology unterstütze ich Fachleute bei der Entwicklung und Analy...
Über diesen Service

Benötigst du Unterstützung bei der Analyse, Integration oder Interpretation von single cell Omics-Daten?

Ich unterstütze Forschungsteams bei der Datenanalyse für scRNA-Seq, single cell Immunrezeptor- oder Spatial-Omics-Analysen.


Maßgeschneiderte Analysen sind möglich: Kontaktiere mich für ein Angebot.


Was ich anbiete:

Bioinformatik-Analyse

  • Bioinformatische Verarbeitung von Rohdaten der Sequenzierung
  • Aggregation, Filterung, Bereinigung, Batch-Korrektur
  • Metadaten-Import
  • Clustering und Cluster-Annotation
  • Differenzielle Genexpression
  • Trajektorien-Inferenz
  • GSEA / GO Term Analyse
  • Analyse der räumlichen Nachbarschaft

Visualisierung & Berichterstellung

  • Jupyter Notebook inklusive Analyse-Code
  • Individuelle PDF- oder HTML-Berichte
  • Dashboards für Datenabfragen

Pipeline-Entwicklung & Automatisierung

  • Automatisierung und Skalierung von Analysepipelines
  • Datenbank- und Cloud-Integration
  • Containerisierung

Datenkuratierung

  • Sammeln von (single-cell) Omics-Daten für eine bestimmte Indikation, Therapieform, Art,...
  • Öffentliche Datenquellen und Datenbanken durchsuchen und integrierte Datensätze zurückgeben


Technologie-Stack

Python / Pandas / scVerse / scipy / Jupyter / TF / Bash / Cell Rank / squidpy / scVelo


Lasst uns gemeinsam bauen!

Hast du ein Projekt im Kopf? Schreib mir, um deine Anforderungen zu besprechen, und ich erstelle eine maßgeschneiderte Lösung.

Programmiersprache:

Python

Technologie:

Jupyter-Notizbuch

Analyse-Typ:

Quantitative Analyse

Qualitative Analyse

Expertise:

Versuchsplanung

Trends

Algorithmen

Cluster-Analyse

Tools:

Andere

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    Extremely knowledgeable researcher with a high quality of work and professionalism. Reliable data analysis with easy to observe and digest results. Highly recommend.

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    Jonathan Alles is an outstanding professional in the field of Data Analytics. His meticulous attention to detail, unwavering professionalism, and exemplary responsiveness greatly contributed to a smooth and efficient collaboration. The quality of his work is exceptional, and I would unreservedly recommend...

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