Ich werde Immunorezeptor TCR BCR Sequenzierungsdaten analysieren

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Einfache Lösungen für komplexe biomedizinische Daten

Hallo, mein Name ist Jonathan Alles. Ich bin unabhängiger Berater für Bioinformatik und Datentechnik. Über meine Agentur EVOBYTE Digital Biology unterstütze ich Fachleute bei der Entwicklung und Analy...
Über diesen Service

Benötigst du Unterstützung bei der Analyse, Integration oder Interpretation von Immunrezeptor-Sequenzierungsdaten, zum Beispiel von (Single Cell) TCR- oder BCR-seq-Tests?


Was ich anbiete:

Bioinformatik-Analyse

  • Bioinformatische Verarbeitung der Rohdaten
  • Aggregation, Filterung, Bereinigung
  • Metadaten-Annotation
  • TCR/BCR-Sequenz-Ausrichtung und Quantifizierung
  • Statistiken zur Genverwendung und statistischer Vergleich
  • TCR/BCR-Tracking
  • Rezeptor-Clustering
  • Integration mit öffentlichen Datenquellen (z. B. VDJ-DB)

Visualisierung & Berichterstellung

  • Jupyter Notebook inklusive Analyse-Code
  • Individuelle PDF- oder HTML-Berichte
  • Dashboards für Datenabfragen

Pipeline-Entwicklung & Automatisierung

  • Automatisierung und Skalierung von Analysepipelines
  • Datenbank- und Cloud-Integration
  • Containerisierung

Datenkuratierung

  • Kuratierung und Zusammenstellung von Datenpaketen aus Literatur oder öffentlichen Repositorien


Technologie-Stack

Python / Pandas / scipy / Jupyter / TF / Bash / MiXCR / Python-Pakete für TCR/BCR-Bioinformatik


Gemeinsam entwickeln!

Hast du ein Projekt im Kopf? Schreib mir, um deine Anforderungen zu besprechen. Ich erstelle einen maßgeschneiderten Plan und ein Angebot, das perfekt zu deinen Zielen passt.

Programmiersprache:

Python

Andere

Technologie:

Excel

Jupyter-Notizbuch

Analyse-Typ:

Quantitative Analyse

Qualitative Analyse

Expertise:

Versuchsplanung

Algorithmen

Statistiken

Tools:

Andere

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