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Ich werde eine epigenetische Analyse integrativ durchführen
Bioinformatik einfach gemacht
Leitender Analyst bei INTEGRATIVE BIOANALYTICS.
Ich bin ein leitender Bioinformatiker und ehemaliger Nasslabor-Wissenschaftler am Dana-Farber Cancer Institute und UT Southwestern. Meine Prioritäten s...
Über diesen Service
Was enthalten ist:
ATAC-seq / ChIP-seq / Cut & Run/Tag
Umfassende Qualitätskontrolle
Ausrichtung + Peak-Calling (Bowtie2/MACS3)
Konsenspeaks, Überlappungen und Signal.
Differenzielle Peak-Analyse (DiffBind)
Visualisierung: PCA, interaktives Volcano-Plot.
Genomische Peak-Annotation (ChIPseeker)
Funktionale Peak-Annotation (ENCODE-SCREEN)
Genom-Spuren zur Visualisierung (BigWig)
Benutzerdefinierte Annotation mit Datensätzen von Interesse.
Beweisbasierte Protein-Footprinting (LOLA/ReMap2022)
Bekannte und de novo Motivanalyse (HOMER).
Weganalyse basierend auf regulatorischen Domänen (GREAT)
Biologischer Bericht
QC-Bericht
Technischer Bericht
Geringfügige Überarbeitungen und Beratung.
FAQ
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Wie viele Proben sind enthalten?
Bis zu 6 Proben.
