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Bioinformatik einfach gemacht
Enthalten ist:
ATAC-seq / ChIP-seq / Cut & Run / Tag
Umfassende Qualitätskontrolle
Ausrichtung + Peak-Calling (Bowtie2/MACS3/SEACR)
Konsenspeaks, Überlappungen und Signal.
Differenzielle Peak-Analyse (DiffBind)
Visualisierung: PCA, interaktives Volcano-Plot.
Genomische Peak-Annotation (ChIPseeker)
Funktionale Peak-Annotation (ENCODE-SCREEN)
Genom-Spuren zur Visualisierung (BigWig)
QC-Bericht
Technischer Bericht
Automatische Übersetzung
Wie viele Proben sind enthalten?
Bis zu 6 Proben.