Ich werde reproduzierbare Omics-Pipelines entwickeln

Reproduzierbare RNA-Seq-, DNA-Seq- und Ribo-Seq-Pipelines

Arbeitest du mit RNA-Seq-, DNA-Seq- oder Ribo-Seq-Daten und brauchst robuste, reproduzierbare Analyse-Workflows?

Ich werde maßgeschneiderte omics-Pipelines mit Snakemake oder Nextflow erstellen, die für Skalierbarkeit, Klarheit und Reproduzierbarkeit ausgelegt sind.

Meine Pipelines folgen den besten Praktiken in der Bioinformatik und sind modular, gut dokumentiert und umweltkontrolliert (Conda oder virtualenv). Egal, ob du eine einzelne Probe oder eine komplette Experimentiercharge verarbeitest, ich helfe dir, QC, Ausrichtung, Quantifizierung und Differentialanalyse zu automatisieren, mit Flexibilität für die Integration downstream-Tools und Visualisierungen.

Dieser Service umfasst vollständig automatisierte RNA-Seq-Analyse-Workflows mit Tools wie STAR, HISAT2 und DESeq2, vom rohen FASTQ bis zur finalen Differentialexpression und Visualisierung.

• Einzel- und Mehrproben-Workflows
• Konfigurierbare Regeln und Parameter
• Klare Ausgabe-Struktur und Dokumentation
• Kompatibel mit lokaler oder HPC-Ausführung
• Optionale ML-fähige Ausgaben und Anreicherungs-Hooks

Lass uns deine Omics-Analyse optimieren und sicherstellen, dass sie publication-ready, reproduzierbar und zukunftssicher ist.

Kontaktiere mich, um dein Projekt zu besprechen, bevor du eine Bestellung aufgibst.