Ich biete Docking- und MD-Simulationsdienste an


Level 2
Über diesen Service
Automatische Übersetzung
DockVision ist mehr als ein typischer Freelancer-Service. Die meisten Anbieter können bioinformatische Dienste anbieten. Der echte Unterschied liegt darin, zu wissen, welche Methode man verwenden muss, wie man den Arbeitsablauf richtig gestaltet und wie man rohe rechnerische Ergebnisse in wissenschaftlich bedeutungsvolle Resultate umwandelt. Hier hebt sich meine Expertise ab.
Ich bin ein rechnerischer Wissenschaftler mit über 5 Jahren praktischer Erfahrung und mehr als 100 abgeschlossenen Projekten für Kunden aus über 30 Ländern. Ich bearbeite komplexe Forschungsabläufe, die über das einfache Ausführen von Software und das Liefern von Basis-Ausgaben hinausgehen.
Meine Fachgebiete umfassen:
- Protein-Ligand-Docking
- Protein-Protein-Docking
- Protein-DNA/RNA-Docking
- Metall-Ion-Docking
- Nanopartikel-Docking
- Peptid-Docking
- Membransimulationen
- Nukleinsäure-Simulationen
- Peptid-/Polymer-Simulationen
- Enhanced-Sampling-MD-Simulationen
Post-Simulation-Analyse:
- MM/PBSA & MM/GBSA
- PCA/DCCM/FEL
- SASA & Rg
- H-Brücken-Analyse
- Clustering-Analyse
- Protein-Ligand-Interaktionsanalyse
- Sekundärstrukturanalyse
- Kontaktkarten-Analyse
- Abstands- & Winkelanalyse
- Residuen-Interaktion
Mein Ziel ist es, wissenschaftlich fundierte, reproduzierbare Analysen mit klarer Interpretation, publikationsreifer Visualisierung und gut organisierten Ergebnissen zu liefern.
Lerne DockVision kennen
Computational Biologist and Data Scientist
Level 2
- AusPakistan
- Mitglied seitAug. 2022
- ⌀ Antwortzeit1 Stunde
- Letzte Lieferung1 Tag
Sprachen
Englisch, Spanisch, Deutsch, Französisch, Italienisch
Automatische Übersetzung
Mein Portfolio
FAQ
Automatische Übersetzung
Sind Sie ein erfahrener Bioinformatiker?
Ja, ich habe über 5 Jahre professionelle Erfahrung in Bioinformatik und arbeite erfolgreich an molekularen Docking-, Molekulardynamik-Simulationen und fortgeschrittenen rechnergestützten Forschungsprojekten für internationale Kunden.
Können Sie Arzneimittelziele vorhersagen?
Ja, ich arbeite mit Sequenzdaten. Je nach Kundenwunsch kann ich Kandidaten für Wirkstofftargets vorhersagen, auch virtuelle Wirkstoffscreenings sind möglich.
Ist der Preis für alle im Gig genannten Aufgaben gleich?
Nein, das ist nicht bei allen Projekten gleich, es hängt vom Projekt und seinem Umfang ab.
Welche Informationen benötigen Sie, um das Projekt zu starten?
Ich benötige die Proteinstruktur (PDB-ID oder Datei), Ligand/Peptid-Struktur und klare Projektziele.
Welche Software benutzt du?
Ich arbeite mit AutoDock Vina, Schrödinger, MOE, HADDOCK, GROMACS, NAMD, ACEMD, Desmond, VMD, PyMOL, ChimeraX, CHARMM-GUI, AmberTools, PLUMED, Python, R, Bash/Linux, Claude Code, Cursor, Jupyter und Python-Bibliotheken wie MDAnalysis, MDTraj, ProDy, Biopython, NumPy, Pandas, Matplotlib und SciPy.
Wie lange sind die MD-Simulationen, die du durchführst?
In der Regel 50–500 ns, je nach Projektanforderungen. Längere Simulationen können bei Bedarf arrangiert werden.
Kannst du bei der Ergebnisinterpretation helfen?
Ja, ich biete eine klare wissenschaftliche Interpretation, um dir zu helfen zu verstehen, ob dein Komplex stabil und vielversprechend ist.
Ist deine Arbeit für die Veröffentlichung geeignet?
Ja, die Analysen und Berichte werden nach akademischen und forschungsbezogenen Standards erstellt.
Welche Analysen sind nach der MD-Simulation enthalten?
RMSD, RMSF, Gyrationsradius, Wasserstoffbrückenanalyse, SASA, Interaktionsstabilität und Bindungsfreie Energie (MM-PBSA/MM-GBSA), PCA, DCCM, FEL, Cluster-Analyse und viele mehr.
Kannst du virtuelle Screenings großer Wirkstoffbibliotheken durchführen?
Ja, ich kann mehrere Verbindungen screenen und sie basierend auf Bindungsaffinität und Interaktionsqualität ranken.
54 Bewertungen für diesen Service
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Zusammensetzung der Bewertung
- Kommunikation
- Qualität der Lieferung
- Preis-Leistungs-Verhältnis der Lieferung
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M maalotaibi

Saudi-Arabien
Laufende ZusammenarbeitThe order was delivered before the agreed time and the quality of work was good, I will do other service with him again
200 $-400 $
Preis
4 Tagen
Dauer
Hilfreich?J joy_hj

Vereinigte Staaten
Laufende Zusammenarbeitnice work N
200 $-400 $
Preis
5 Tagen
Dauer
Hilfreich?J joy_hj

Vereinigte Staaten
Laufende Zusammenarbeitgrt work and fast
50 $-100 $
Preis
2 Tagen
Dauer
Hilfreich?A aashamrani

Saudi-Arabien
Laufende Zusammenarbeitoutstanding effort and truly excellent work.
400 $-600 $
Preis
9 Tagen
Dauer
Hilfreich?J just_som_motion

Italien
Laufende ZusammenarbeitOttimo lavoro ed attenzione ai dettagli
50 $-100 $
Preis
2 Tagen
Dauer
H 
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