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Ich werde einen automatisierten fasta-Sequenzanalyse-Workflow in bash und python erstellen
Wechsel in die Bioinformatik
Derzeit erweitere ich meine Fähigkeiten in Linux-Terminal-Workflows, NCBI/EMBL-EBI-Datenbanken und Sequenzanalyse.
🎯 Ziel ist es, zu Open-Source-Bioinformatik-Tools und der computergestützten Forschu...
Über diesen Service
Suchst du nach einem zuverlässigen und schnellen automatisierten Workflow, um FASTA-Biosequenzen ohne manuelle Arbeit zu verarbeiten?
Ich spezialisiere mich auf den Aufbau modularer, reproduzierbarer Bash- und Python-Workflows, die speziell für die NCBI FASTA-Sequenzextraktion und die nachgelagerte Bioinformatik-Analyse entwickelt wurden.
### Was ich in diesem Gig anbiete:
- Automatisierte NCBI-Sequenzabfrage: Batch-Download von FASTA-Sequenzen anhand von Accession IDs.
- Sequenzstatistiken & Metriken: Berechnung der Gesamtlänge, GC/AT-Gehalt in Prozent und N50-Statistiken.
- Fensterbasierte GC-Profilierung: Detaillierte GC-Gehalt-Analyse über gleitende Fenster.
- Sequenzmanipulation: Automatisierte Reverse-Complement-Generierung und Bereinigung der FASTA-Header.
- Strukturierte Datenexporte: Saubere TSV/CSV-Berichte für die nachgelagerte Analyse.
### Warum meinen Service wählen?
- Sauberer, gut dokumentierter Code: Modulare Bash- und Python-Skripte, die für eine nahtlose Wiederverwendung konzipiert sind.
- Speicheroptimierte Workflows: Effiziente Befehlszeilenausführung in Linux-Umgebungen.
- Schnelle Bearbeitung & voller Support: Detaillierte Benutzeranleitungen für eine reibungslose Ausführung auf deinem Terminal.
Fühl dich frei, mir vor der Bestellung eine Nachricht mit deinen spezifischen Projektanforderungen zu schicken!
