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Ich werde Ihre Fastq-Proben herunterladen und mit dem Genom abgleichen
Als Doktorand am National Cancer Research Center spezialisiere ich mich auf fortgeschrittene bioinformatische Analysen, vor allem in den Bereichen RNA-seq, CRISPR-Screening, Single-Cell-RNA-seq, Spati...
Level 1
Hat bestimmte Leistungskriterien erfüllt und zeigt großes Potenzial auf dem Marktplatz.
Über diesen Service
Öffentliche Microarray- oder RNAseq-Daten sind für verschiedene Analysen äußerst nützlich. Diese Dateien sind sehr groß, und es ist eine leistungsstarke Recheninfrastruktur erforderlich, um sie zu erhalten. Mithilfe eines Linux-HPC lade ich alle Ihre Daten (Fastq-Proben) aus öffentlichen Datenbanken wie SRA, ENA, NIH usw. herunter. Ich ordne sie mithilfe von STAR oder Salmon Aligner dem Genom (Mensch, Maus, Zebrafisch usw.) zu und erstelle Ihnen die Rohdaten, mit denen Sie nachfolgende Analysen durchführen können.
Darüber hinaus stelle ich Ihnen einen HTML-Bericht mit den Messwerten, Statistiken und Qualitätskontrollschritten der ausgerichteten Proben zur Verfügung.
Jede Probe kostet 5 $
Wenn du Fragen hast, schreib mir und wir reden!
Technologie:
Python
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RStudio
•
Andere
Informationstyp:
Notierungen
•
Andere
Technik:
Anleitung
