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Ich werde deine Single-Cell-RNA-Seq-Daten analysieren und maßgeschneiderte Einblicke liefern
Die Zukunft der Biologie programmieren
Genyx LLC ist ein Biotech-, Bioinformatik- und KI-getriebenes Softwareunternehmen, das Next-Generation-Lösungen für Genomik, Gesundheitswesen und Lebenswissenschaften entwickelt. Wir sind spezialisier...
Über diesen Service
Ich biete maßgeschneiderte Single-Cell-RNA-Seq-Analysen an, die auf deinen Datensatz und deine Forschungsziele abgestimmt sind. Jedes Projekt wird an die biologische Fragestellung angepasst, wobei reproduzierbare Workflows in R oder Python (Seurat, Scanpy usw.) angewendet werden, um hochwertige und interpretierbare Ergebnisse zu liefern.
Die Dienstleistungen umfassen:
- Qualitätskontrolle und Filterung
- Normalisierung, Skalierung und Dimensionsreduktion (PCA, UMAP/t-SNE)
- Clustering und Marker-Gen-Identifikation
- Optionale Zelltyp-Annotation und Pfadwegerweiterung
- Erstellung von publikationsfertigen Visualisierungen und Zusammenfassungsberichten
Mit über vier Jahren Erfahrung in Bioinformatik und mehreren Omics-Disziplinen stelle ich sicher, dass jede Analyse robust, transparent und biologisch bedeutungsvoll ist. Bitte kontaktiere mich vor der Bestellung, um deine Daten und Analyseziele zu besprechen.
Mein Portfolio
FAQ
Automatische Übersetzung
Welche Art von Daten kann ich bereitstellen?
Du kannst entweder Roh-FASTQ-Dateien (zur Verarbeitung mit Cell Ranger oder Ähnlichem) oder verarbeitete Count-Matrizen (z.B. .mtx, .h5 oder .csv) bereitstellen. Ich passe den Workflow entsprechend dem Datentyp und deinen Projektzielen an.
Führe ich die Rohdatenverarbeitung durch (FASTQ zu Count-Matrix)?
Ja. Dieser Schritt kann als Zusatzdienstleistung hinzugefügt werden und umfasst Read-Alignment, UMI-Zählung und die Erstellung der Expressionsmatrix für die nachgelagerte Analyse.
Welche Tools nutzen Sie für die Analyse?
Ich verwende hauptsächlich Seurat, Scanpy, Monocle3 und Cell Ranger sowie Standard-R- und Python-Pakete für Visualisierung und Enrichment-Analysen.
Kannst du mehrere Proben oder Chargen integrieren?
Ja. Batch-Korrektur und Multi-Sample-Integration können als Zusatzoption hinzugefügt werden. Ich verwende je nach Datensatzcharakteristik Seurat v4, Harmony oder Scanorama.
Wie besprechen wir die biologische Fragestellung oder den Analyseplan?
Vor Beginn tauschen wir einige Nachrichten aus, um deine Hauptziele und Daten-Details zu definieren. Ich bestätige dann das beste Paket oder schlage ein individuelles Angebot vor, falls nötig.
