Ich führe Rnaseq NGS-Analyse von Rohdaten bis zu differentieller Expression durch

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Farah Saleem

Pakistan

Ich spreche Urdu, Englisch

2 Aufträge abgeschlossen

Wo Forschungskompetenz auf hervorragendes akademisches Schreiben trifft

Ich bin Bioinformatiker, Forscher und wissenschaftlicher Autor mit fortgeschrittenen Kenntnissen in Python, C, C++ und Front-End-Entwicklung (HTML, CSS, JavaScript, Bootstrap). Mein fundierter Hinterg...
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Über diesen Service

Ich biete End-to-End-RNA-seq- und NGS-Analysen an, von rohen Sequenzierdaten bis zu Ergebnissen der differentiellen Expression und publikationsfertigen Visualisierungen.

Was ich liefere:

  • Qualitätskontrolle & Read-Trimming (FastQC, fastp)
  • Ausrichtung/Quantifizierung (Salmon)
  • Analyse der differentiellen Expression (DESeq2 in R)
  • Visualisierungen: Volcano-Plots, PCA-Plots, Heatmaps
  • Pfad- und Anreicherungsanalyse (GO/KEGG) Premium-Paket
  • ML-basierte prädiktive Modellierung auf Expressionsdaten Premium-Paket

Tools: Python, R, Salmon, DESeq2, tximport, ggplot2

Ob du die komplette Pipeline brauchst oder nur bei einem Schritt Unterstützung möchtest, zum Beispiel, wenn du bereits eine Counts-Matrix hast und nur Differenzielle Expression und Plots benötigst – ich kann dort ansetzen, wo deine Daten gerade sind.

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do rnaseq ngs analysis from raw reads to differential expression
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