Ich werde RNA-Seq-Daten mit deseq2, edger, go, kegg und pca analysieren

Suchst du eine gründliche, publikationsreife RNA-seq-Analyse, nicht nur ein Skript, das eine CSV ausgibt?

Ich bin Dr. Faisal, ein PhD Pflanzenmolekularbiologe und Postdoktorand (Connecticut Agricultural Experiment Station, USA) mit über 35 peer-reviewed Veröffentlichungen und praktischer RNA-seq-Erfahrung bei mehr als 20 Arten.

WAS DU BEKOMMST:

QC (FastQC/MultiQC)

Trimmen und Alignment (HISAT2/STAR oder kallisto/salmon)

Differenzielle Expression (DESeq2/edgeR)

PCA, Volcano-Diagramme, Heatmaps

GO-Anreicherung und KEGG-Pfad-Analyse

Geschriebene biologische Interpretation

FÜR WEN DAS IST:

Master-Studierende, Postdocs und Labore mit rohen FASTQ- oder Count-Daten, die eine korrekte, publikationsfähige Analyse benötigen, nicht nur Zahlen.

WAS ICH VON DIR BRAUCHE:

FASTQ-Dateien, Count-Matrix oder SRA-Zugänge

Experimentelles Design (welche Proben gehören zu welcher Gruppe)

Referenzgenom/-art

Schreib mir vor der Bestellung, wenn dein Datensatz groß ist oder es sich um eine Nicht-Modell-Art handelt, damit ich ein genaues Angebot machen kann.