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Ich werde eine Bioinformatik-Analyse von Sequenzierungsdaten durchführen
Bioinformatik-Analyst und Koordinator für klinische Forschung
Ich bin MSc-Absolvent in Bioinformatik, Gesundheitsfachmann und Koordinator für klinische Forschung mit Schwerpunkt auf Infektionskrankheiten und Mikrobiomforschung. Ich unterstütze akademische Teams ...
Über diesen Service
Ich biete praktische, reproduzierbare bioinformatische Unterstützung für Sequenzierungs- und Mikrobiomforschungsprojekte.
Ich kann bei Metadaten-Organisation, Proben- und Lauf-ID-Checks, FASTQ-Qualitätskontrolle, Adapter- und Qualitäts-Trimming, MultiQC-Berichten, Entfernung von Wirts-Reads, taxonomischer Profilierung, explorativen Analysen und klaren forschungsbereiten Berichten helfen.
Du erhältst strukturierte Ausgaben, die auf dein Projekt zugeschnitten sind, wie gereinigte Metadaten-Dateien, QC-Berichte, Zusammenfassungstabellen, Abbildungen und reproduzierbare Notizbücher oder Skripte, falls in deinem Paket enthalten.
Ich arbeite mit Excel/CSV/TSV-Dateien und Sequenzierungsdaten, unter Verwendung von Python, R, Linux, FastQC, MultiQC, fastp, KneadData, Bowtie2 und MetaPhlAn.
Bitte sende nur de-Identifizierte Daten. Dieser Service ist für Forschungs- und Bildungszwecke gedacht und bietet keine klinische Diagnose oder medizinische Interpretation.
Für große Datensätze, individuelle Workflows oder spezielle Forschungsfragen kontaktiere mich bitte vor der Bestellung, damit wir den Umfang und die Ergebnisse klären können.
Mein Portfolio
FAQ
Automatische Übersetzung
Mit welchen Daten kannst du arbeiten?
Ich kann mit de-Identifizierten Excel-, CSV-, TSV-, FASTQ- und Sequenzierungs-Metadaten-Dateien arbeiten. Bitte kontaktiere mich zuerst für BAM-, VCF- oder andere Formate.
Was bekomme ich?
Je nach Paket erhältst du gereinigte Metadaten, FASTQ-QC-Berichte, MultiQC-Zusammenfassungen, getrimmte Reads, taxonomische Tabellen, Abbildungen, Berichte und reproduzierbaren Code.
Verarbeitest du paired-end FASTQ-Dateien?
Ja. Ich kann Qualitätskontrolle und konservatives Trimming für paired-end oder single-end Sequenzierungsdaten durchführen. Bitte teile mir vor der Bestellung die Anzahl der Dateien und die Gesamtkomprimierungsgröße mit.
Kannst du Mikrobiom-Daten analysieren?
Ja. Ich unterstütze Mikrobiom- und Metagenomforschungs-Workflows, inklusive Metadaten-Organisation, QC, Vorverarbeitung, taxonomischer Profilierung und explorativen Analysen.
Stellst du klinische Interpretation oder Diagnosen bereit?
Nein. Dieser Gig ist nur für Forschungs- und Bildungszwecke. Ich stelle keine klinischen Diagnosen, Behandlungsempfehlungen oder medizinische Interpretationen bereit.
Wie soll ich meine Daten teilen?
Bitte sende nur de-Identifizierte Dateien. Für große Sequenzierungsdatensätze kontaktiere mich vor der Bestellung, um eine sichere Übertragungsmethode und den Projektumfang zu vereinbaren.
Kannst du mit großen oder individuellen Projekten arbeiten?
Ja. Große Datensätze, komplexe Studien-Designs und individuelle Workflows erfordern ein individuelles Angebot. Bitte sende mir eine Nachricht mit deiner Forschungsfrage, Dateitypen, Anzahl der Proben und Gesamtdateigröße.
