Ich werde Live-Zoom-Training zur molekularen Dynamik-Simulation anbieten

Ich biete Schritt-für-Schritt-Anleitungen, die speziell für Anfänger, Studierende und Forscher entwickelt wurden, die MD-Workflows mit GROMACS meistern möchten.

Pakete

Basic: Protein MD Simulation

Lerne den vollständigen Workflow für die Simulation eines Proteins in Wasser.

Kompletter GROMACS-Workflow

Systemeinrichtung: Protein in Wasser, Box-Dimensionen bis zu 10 × 10 × 10 nm

Wichtige Analysetools:

RMSD, RMSF, Radius of Gyration (Rg), Wasserstoffbrücken

Standard: Protein-Ligand MD Simulation

Beinhaltet alles im Basic-Paket plus:

Vorbereitung und Simulation eines Protein-Ligand-Komplexes in Wasser

Workflow zur Ligand-Topologie-Erstellung

Zusätzliche Analysen, die für Bindungsstudien relevant sind

Premium: Fortgeschrittene MD Simulation

Beinhaltet alles im Standard-Paket plus:

Membranprotein MD Simulation (Membranaufbau + Einfügung)

Zusätzliche Analyseoptionen wie:

Distanz, SASA, Clustering, MSD, Kontakte, benutzerdefinierte Plots usw.

Geeignet für komplexe, publikationsfähige Projekte

Wichtige Hinweise

Bitte teile deine Protein-PDB-Datei oder PDB-ID vor der Sitzung.

Für sehr große oder multimerische Proteine oder komplexe Analysen gelten individuelle Preise.