Ich werde Proteinmodellierung für Docking und Dynamik durchführen

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Drugdiscovery

5,0

Bangladesch

Ich spreche Englisch

35 Aufträge abgeschlossen

Ich habe über 15 Jahre Erfahrung im Bereich Life Sciences in den USA, Japan und Bangladesch. Ich habe mehr als 30 Forschungsartikel in renommierten internationalen peer-reviewed Zeitschriften veröffen...

Level 2

Hat hohe Leistungskriterien erfüllt und verfügt über eine nachgewiesene Erfolgsbilanz bei der Erfüllung von Kundenerwartungen.

Über diesen Service

Die Auswahl und Vorbereitung der 3D-Struktur des Zielproteins ist der Schlüssel zu einem erfolgreichen Experiment zum molekularen Docking und/oder zur molekularen Dynamiksimulation.

Ich kann folgende Dienstleistungen anbieten:

Wählen Sie Zielprotein(e) durch eine Literaturrecherche aus.
Verfeinern Sie die 3D-Struktur (wenn eine PDB-Datei oder PDB-ID bereitgestellt wird)
Swiss-Model-Homologiemodellierung aus der FASTA-Sequenz oder der UniProt-ID
Modellierer Homologiemodellierung
I-TASSER für Ab-initio-Modellierung

## Experimentell abgeleitete 3D-Strukturen sind in verschiedenen Datenbanken verfügbar, wie zum Beispiel

RCSB-PDB
EBI
PDBJ
PDBSUM

## Computergestützt abgeleitete Strukturen hoher Qualität finden Sie auch unter

ALPHAFOLD

## Wenn in den oben genannten Quellen keine 3D-Strukturen verfügbar sind, können wir Strukturen mithilfe der Homologiemodellierung von Swissmodel erstellen. Wir benötigen jedoch die Aminosäuresequenz (FASTA) des Zielproteins. Normalerweise rufen wir die Sequenz aus der UniProt-Datenbank ab. In diesem Fall sollten wir die UniProt-ID des Zielproteins haben.